GSE19399：跨多人类癌症类型的Affymetrix 250K StyI SNP芯片数据
该数据集为Affymetrix 250K StyI SNP芯片数据，覆盖多种人类癌症类型，来源于NCBI。源站描述提及对3131例癌症样本的体细胞拷贝数改变（SCNA）进行高分辨率分析，样本主要属于26种组织学类型，识别出158个在多种癌症类型中显著频发改变的局灶SCNA区域，其中122个无法由已知
基本信息
资源简介
GSE19399：跨多人类癌症类型的Affymetrix 250K StyI SNP芯片数据
Affymetrix 250K StyI SNP array data across multiple human cancer types
该数据集为Affymetrix 250K StyI SNP芯片数据，覆盖多种人类癌症类型，来源于NCBI。源站描述提及对3131例癌症样本的体细胞拷贝数改变（SCNA）进行高分辨率分析，样本主要属于26种组织学类型，识别出158个在多种癌症类型中显著频发改变的局灶SCNA区域，其中122个无法由已知癌症靶基因解释，并涉及BCL2家族与NF-κΒ通路等候选基因。数据可用于肿瘤基因组变异分析（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Dec 09 200。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：发现导致肿瘤发生的关键基因的一种有力方法是识别在人类癌症中频繁发生改变的基因组区域。我们已报道了对3131例癌症样本（主要属于26种组织学类型）的体细胞拷贝数改变（SCNA）的高分辨率分析。我们识别出158个在多种癌症类型中以显著频率发生改变的局灶SCNA区域，其中122个无法由位于这些区域内的已知癌症靶基因的存在来解释。若干候选基因和基因家族在这些局灶SCNA区域中富集，包括凋亡调节因子BCL2家族的成员和NF-κΒ通路。我们表明，携带MCL1和BCL2L1抗凋亡基因周围扩增的癌细胞依赖这些基因的表达来生存。最后，我们证明大部分
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：Genome variation profiling by SNP array、GPL3720、9606。本站分类：肿瘤。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE19399
【使用注意】
· 源站最后修改于 Aug 21 201，引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE19399
标准获取流程：
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- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
发现参与肿瘤发生因果作用的关键基因的一种有力方法是识别在人类癌症中频繁发生改变的基因组区域。我们报道了对3131例癌症标本（主要属于26种组织学类型）的体细胞拷贝数改变（SCNAs）的高分辨率分析。我们识别出158个局灶性SCNA区域，这些区域在多种癌症类型中以显著频率发生改变，其中122个区域无法用位于这些区域内的已知癌症靶基因的存在来解释。若干候选基因及基因家族在这些局灶性SCNA区域中富集，包括凋亡调节因子BCL2家族的成员以及NF-κΒ通路。我们表明，携带MCL1和BCL2L1抗凋亡基因周围扩增的癌细胞依赖这些基因的表达来生存。最后，我们证明在个别癌症类型中识别出的大多数SCNAs存在于多种癌症类型中。
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