平坦上皮异型（DIN1a）与小叶上皮内瘤变的阵列比较基因组杂交分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE18187

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数据说明

低级别平坦型导管上皮内瘤变（DIN1a，平坦型上皮异型增生）是乳腺最早可在形态学上识别的肿瘤性病变之一。它常与小叶上皮内瘤变（LIN）伴随发生。本研究旨在通过微阵列比较基因组杂交（CGH）分析，阐明这些早期乳腺肿瘤性病变中的染色体畸变。我们对12例存档的福尔马林固定、石蜡包埋标本进行了激光捕获显微切割，这些标本同时含有DIN1a和LIN病灶。所有分析的DIN1a和LIN病例均显示染色体获得和缺失。最常见的畸变是16q缺失，见于7例DIN1a（70%）和10例LIN（91%）病例。关于1号染色体的改变，4例DIN1a（40%）和7例LIN（64%）病例显示1q获得。我们的研究结果表明，在若干同时存在LIN和低级别平坦型DIN的病例中，出现了1q获得和16q缺失的同步染色体畸变。已知这些畸变在低级别浸润性导管癌以及更晚期（常规）类型的低级别DIN（低级别导管原位癌）中很常见。

我们的结果提示，在大多数同时存在LIN和低级别平坦型DIN的病例中，可能存在相似的分子遗传通路。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。