GSE180400：METTL8介导的线粒体tRNA m3C修饰平衡线粒体翻译

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE180400

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

线粒体含有一种特定的翻译机器，用于合成由线粒体基因组编码的呼吸链组分。线粒体tRNA（mt-tRNA）同样由线粒体基因组产生，并且与其细胞质对应物相似，在多个位点上被修饰。在此，我们发现RNA甲基转移酶METTL8是一种线粒体蛋白，它促进mt-tRNASer(UCN)和mt-tRNAThr第C32位点的m3C甲基化。METTL8敲除细胞的呼吸链活性降低，而过表达细胞的呼吸链活性增强。在胰腺癌中，METTL8水平较高，这与患者生存率相关。事实上，METTL8上调刺激了这些细胞中的呼吸链活性。利用核糖体图谱分析进行的核糖体占据分析显示，核糖体在mt-tRNASer(UCN)和mt-tRNAThr密码子上停滞，而对天然核糖体亚复合物的质谱分析揭示了线粒体编码蛋白ND6和ND1的呼吸链整合减少。

因此，通过METTL8介导的C32甲基化对mt-tRNASer(UCN)和mt-tRNAThr密码子进行良好平衡的翻译，可能提供最佳的呼吸链组成和功能。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。