恒河猴错配修复缺陷结直肠癌模型（RNA-Seq）
数据基于高通量测序进行表达谱分析，涉及 GPL23949 平台与恒河猴（9544）。可用于研究错配修复缺陷相关结直肠癌的致癌机制、免疫治疗与疫苗开发以及化学预防策略，并与人类散发性 MSI-H 及 Lynch 综合征结直肠癌相对应（来源 NCBI）
基本信息
资源简介
恒河猴错配修复缺陷结直肠癌模型（RNA-Seq）
Rhesus Macaque Model of Mismatch Repair-Deficient Colorectal Cancer (RNA-Seq)
该数据集来自 NCBI GEO（GSE178381），为恒河猴错配修复缺陷结直肠癌模型的 RNA-Seq 表达谱数据，包含 1 个文件（GSE178381_series_matrix.txt.gz）。数据基于高通量测序进行表达谱分析，涉及 GPL23949 平台与恒河猴（9544）。可用于研究错配修复缺陷相关结直肠癌的致癌机制、免疫治疗与疫苗开发以及化学预防策略，并与人类散发性 MSI-H 及 Lynch 综合征结直肠癌相对应（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Jun 17 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：结直肠癌（CRC）仍是美国第三大常见癌症，其中 15% 的病例继发于 Lynch 综合征（LS）或 MLH1 启动子体细胞超甲基化而表现出微卫星不稳定性（MSI）。我们机构的一群恒河猴发生了自发性错配修复缺陷（MMRd）CRC，其中相当一部分携带 MLH1 致病性种系突变。DNA 甲基化和转录组分析被用于评估恒河猴作为模式生物，以研究癌变、开发免疫疗法和疫苗，并实施与人类散发性 MSI-H 和 LS CRC 相关的化学预防方法。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL23949、9544。本站分类：肿瘤/其他。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE178381
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jun 30 202，引用时请注意版本时效。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
结直肠癌（CRC）仍是美国第三大常见癌症，其中15%的病例表现为微卫星不稳定性（MSI），继发于Lynch综合征（LS）或MLH1启动子的体细胞超甲基化。我们机构的一群恒河猴出现了自发性错配修复缺陷（MMRd）结直肠癌，其中相当一部分携带MLH1的致病性种系突变。DNA甲基化和转录组分析被用于评估恒河猴作为模式生物，以研究癌变过程、开发免疫疗法和疫苗，并实施与人类散发性MSI-H和LS结直肠癌相关的化学预防方法。NIH资助：资助编号：5 P30 CA016672-44 资助名称：癌症中心支持资助 所属机构：德克萨斯大学MD安德森癌症中心 资助方：NCI
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
