胆囊癌与黄色肉芽肿性胆囊炎患者血清外泌体差异表达mRNA、lncRNA和circRNA数据集

该数据集来自NCBI GEO(GSE166915),包含胆囊癌(GBC)与黄色肉芽肿性胆囊炎(XGC)患者血清外泌体的RNA测序表达谱,覆盖mRNA、lncRNA和circRNA

geo
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基因组分类GPL212909606
GSE166915: Exploration of differentially-expressed exosomal mRNAs, lncRNAs and circRNAs from serum samples of gallbladder cancer and xantho-granulomatous cholecystitis patients

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-25

资源简介

胆囊癌与黄色肉芽肿性胆囊炎患者血清外泌体差异表达mRNA、lncRNA和circRNA数据集

Exploration of differentially-expressed exosomal mRNAs, lncRNAs and circRNAs from serum samples of gallbladder cancer and xantho-granulomatous cholecystitis patients

该数据集来自NCBI GEO(GSE166915),包含胆囊癌(GBC)与黄色肉芽肿性胆囊炎(XGC)患者血清外泌体的RNA测序表达谱,覆盖mRNA、lncRNA和circRNA。通过高通量RNA测序及生物信息学分析,研究者鉴定了两组间差异表达的编码与非编码RNA,可用于探索GBC早期诊断与治疗相关的特异性生物标志物,并支持外泌体RNA在肿瘤发生发展中的功能研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Feb 17 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):胆囊癌(GBC)是全球最常见的胆道恶性肿瘤。尽管越来越多的研究致力于探索GBC的机制,但很少有分子可作为GBC早期诊断和治疗的特异性生物标志物。近期研究表明,外泌体不仅参与肿瘤进展,还携带可定义多种癌症类型的特异性信息。本研究旨在探究GBC患者血浆来源外泌体中编码和非编码RNA(lncRNA和circRNA)的表达谱。通过使用高通量RNA测序及随后的生物信息学分析,我们鉴定出与黄色肉芽肿性胆囊炎(XGC)外泌体相比,GBC外泌体中多个差异表达(DE)的mRNA、lncRNA和circRNA。然后我们应用了基因本体

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL21290、9606。本站分类:肿瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE166915

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jul 01 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

胆囊癌(GBC)是全球最常见的胆道恶性肿瘤。尽管越来越多的研究致力于探索GBC的机制,但可用于GBC早期诊断和治疗的特异性生物标志物分子仍然很少。近年来的研究表明,外泌体不仅参与肿瘤的进展,还携带能够界定多种癌症类型的特异性信息。本研究旨在探讨GBC患者血浆来源外泌体中编码RNA和非编码RNA(lncRNA和circRNA)的表达谱。通过高通量RNA测序及随后的生物信息学分析,我们鉴定出GBC外泌体与黄色肉芽肿性胆囊炎(XGC)外泌体相比存在多个差异表达(DE)的mRNA、lncRNA和circRNA。随后我们应用基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析来探究这些差异表达RNA的潜在功能。

此外,我们探索了这些差异表达RNA及其靶基因的相互作用网络和竞争性内源RNA网络,揭示了编码RNA与非编码RNA之间复杂的调控网络。总之,本研究将为血浆来源外泌体在胆囊癌中的诊断价值提供证据,并为胆囊癌的新机制提供新的视角。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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