GSE166165：NOX4连接胰腺癌代谢调控与内质网氧化还原脆弱性及对PRDX4的依赖

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE166165

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

PDAC细胞获得代谢改变，增强NADPH生成和胞质氧化还原稳态。本研究表明，高NADPH水平驱动内质网(ER)膜上表达的NADPH氧化酶4 (NOX4)活性。NOX4产生的H2O2由ER腔内的过氧化物还原酶4 (PRDX4)代谢。利用功能基因组学及随后的体外和体内验证，我们发现具有高NADPH水平的PDAC细胞系的生长和存活依赖于PRDX4。PRDX4依赖与活性氧增加、DNA-PKcs调控的DNA损伤反应和放射敏感性相关，而敲低NOX4或NADPH可逆转这一现象。因此，本研究鉴定出NOX4作为一种蛋白， paradoxically将胞质的还原力转化为PDAC中ER特异性氧化应激脆弱性，可通过靶向PRDX4进行治疗性利用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。