HEY1-NCOA2与RUNX2相互作用诱导间叶性软骨肉瘤[Array]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE163291

标准获取流程：

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数据说明

间叶性软骨肉瘤是一种高级别恶性肿瘤，其特征为低分化小圆细胞与高分化软骨的双相生长。间叶性软骨肉瘤影响青少年和年轻成人，HEY1-NCOA2融合基因与大多数病例存在因果关系。在此，我们通过将HEY1-NCOA2导入小鼠胚胎软骨生成祖细胞，随后皮下移植到裸鼠体内，构建了间叶性软骨肉瘤的小鼠模型。HEY1-NCOA2的表达成功在68.9%的受体中诱导了皮下肿瘤，显示出双相形态以及Sox9的表达，Sox9是软骨生成分化的主调控因子，为人类间叶性软骨肉瘤的典型特征。染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq）分析表明，HEY1-NCOA2结合峰中频繁包含RUNX DNA共有序列。Runx2对软骨细胞谱系的分化和增殖具有重要作用，在小鼠间叶性软骨肉瘤中恒定表达，并且使用NCOA2 C端结构域观察到HEY1-NCOA2与Runx2之间的相互作用。

这种相互作用促进了对Runx2靶基因（如Adamts4和Mmp13）的抑制，从而抑制软骨细胞分化和肿瘤细胞生长，而使用HDAC抑制剂Panobinostat治疗可消除HEY1-NCOA2和Runx2的抑制活性，从而在体外和体内均抑制肿瘤生长。这些结果表明，HEY1-NCOA2的表达通过调节RUNX2调控的转录程序，诱导软骨源性祖细胞的恶性转化。我们使用微阵列来详细分析小鼠间充质软骨肉瘤中基因表达的全局程序。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。