食管鳞状细胞癌患者表达数据
数据可用于差异表达基因分析、基因集富集分析，以及分泌蛋白编码差异基因和食管特异性差异基因的汇总研究，为 ESCC 早期诊断与治疗靶点探索提供线索（来源 NCBI）
基本信息
资源简介
食管鳞状细胞癌患者表达数据
Expression data from esophageal squamous cell carcinoma patients
该数据集来自 NCBI GEO，基于 Affymetrix Gene Chip Human Genome U133 plus 2.0 Array 对 28 例 I-III 期食管鳞状细胞癌（ESCC）患者进行芯片实验，包含 1 个系列矩阵文件。数据可用于差异表达基因分析、基因集富集分析，以及分泌蛋白编码差异基因和食管特异性差异基因的汇总研究，为 ESCC 早期诊断与治疗靶点探索提供线索（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Nov 16 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：我们基于 Affymetrix Gene Chip Human Genome U133 plus 2.0 Array 对 28 例 I-III 期 ESCC 患者进行了芯片实验，对差异表达基因（DEGs）进行了富集分析，并对所有有效基因进行了基因集富集分析。此外，我们汇总了分泌蛋白编码的 DEGs 以及食管特异性 DEGs，希望为 ESCC 的早期诊断和更有效治疗靶点提供一些线索。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：Expression profiling by array、GPL570、9606。本站分类：肿瘤。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE161533
【使用注意】
· 源站最后修改于 Nov 19 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE161533
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们基于Affymetrix Gene Chip Human Genome U133 plus 2.0 Array对28例I-III期ESCC患者进行了微阵列实验，对差异表达基因（DEGs）进行了富集分析，并对所有有效基因进行了基因集富集分析。此外，我们总结了编码分泌蛋白的DEGs以及食管特异性DEGs，希望为ESCC的早期诊断和更有效治疗靶点提供一些线索。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
