FDA批准药物用于恶性外周神经鞘瘤治疗的转录组重定位研究
该数据集来自 NCBI GEO(GSE159896),包含 1 个文件,聚焦 FDA 批准药物对恶性外周神经鞘瘤(MPNST)细胞系的转录组影响

基本信息
资源简介
FDA批准药物用于恶性外周神经鞘瘤治疗的转录组重定位研究
Repurposing FDA-approved drugs for the treatment of malignant peripheral nerve sheath tumors
该数据集来自 NCBI GEO(GSE159896),包含 1 个文件,聚焦 FDA 批准药物对恶性外周神经鞘瘤(MPNST)细胞系的转录组影响。数据通过高通量测序获取表达谱,比较用药前后细胞系的转录组变化,可用于分析 Fludarabine 及 Colchicine 联合处理引发的信号通路改变,支持药物重定位与 MPNST 治疗候选药物的转录组层面研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Oct 22 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):恶性外周神经鞘瘤(MPNSTs)是起源于施万细胞谱系的侵袭性软组织肉瘤。它们占所有软组织肉瘤的比例高达10%。尽管MPNSTs对新治疗药物的需求尚未得到满足,但迄今为止对该肿瘤类型的转录组分析很少。我们研究了FDA批准用于MPNST治疗的药物,并比较了它们在处理前后细胞系中的转录组变化。我们在Ingenuity Pathway Analysis(IPA)和Gene Set Enrichment Analysis(GSEA)分析中证明,经Fludarabine处理的NF1 MPNST细胞表现出信号通路的改变,如Wnt/Ca+通路的上调和hedgehog及缺氧信号通路的下调。Colchicine和Fludarabine联合处理通过改变信号通路增强了散发性MPNST细胞的细胞毒性,包括
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24676、9606。本站分类:肿瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE159896
【使用注意】
· 源站最后修改于 Oct 21 202,引用时请注意版本时效。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE159896
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
恶性外周神经鞘瘤(MPNSTs)是一种起源于施万细胞系的侵袭性软组织肉瘤。它们占所有软组织肉瘤的比例高达10%。尽管目前对MPNSTs新型治疗药物的需求尚未得到满足,但迄今为止针对该肿瘤类型的转录组分析研究仍较少。我们研究了FDA批准的用于MPNST治疗的药物,并比较了这些药物处理前后细胞系中的转录组变化。我们证明,在Ingenuity通路分析(IPA)和基因集富集分析(GSEA)中,经氟达拉滨处理的NF1型MPNST细胞表现出信号通路的改变,如Wnt/Ca+通路的上调和hedgehog及缺氧信号通路的下调。秋水仙碱与氟达拉滨联合处理通过改变信号通路(包括Wnt/β-catenin通路的增强等)增强了散发性MPNST细胞的细胞毒性。比较NF1型/散发性MPNST细胞与正常施万细胞的转录组分析表明,与散发性MPNST细胞相比,NF1型MPNST细胞具有更多的剪接事件、更少的单核苷酸变异以及诱导的RNA表达。
总之,我们识别出了MPNSTs与雪旺细胞之间、散发性MPNST细胞与NF1型MPNST细胞之间,以及药物治疗的MPNST细胞与溶剂对照处理的细胞之间的转录组差异。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




