原发性和继发性骨髓纤维化粒细胞基因表达谱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE159514

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

原发性骨髓纤维化（PMF）与真性红细胞增多症（PV）和原发性血小板增多症（ET）同属经典的费城染色体阴性骨髓增殖性肿瘤（MPNs）。PV和ET可演变为继发性骨髓纤维化（SMF），分别形成PV后（PPV）和ET后（PET）骨髓纤维化（MF）。目前PMF和SMF患者的治疗方式相同，生存预测也基于相同的预后模型，尽管已有研究表明这些模型无法在SMF中准确区分不同的风险类别。近年来，基因表达谱分析（GEP）为临床决策提供有价值预后信息的能力日益受到关注。为构建能够根据基因表达预测生存的分子特征，我们利用微阵列平台研究了114例MF患者粒细胞的GEP，其中包括35例纤维化前/早期PMF（Pre-PMF）、37例明显PMF（Overt-PMF）、26例PET和16例PPV。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。