胆管癌细胞系及regorafenib处理的表达数据
该数据集来自 NCBI GEO，标题为胆管癌细胞系及 regorafenib 处理的表达数据，包含 1 个文件 GSE149131_series_matrix.txt.gz，采用 GPL570 平台对人类（9606）样本进行表达谱芯片检测
基本信息
资源简介
胆管癌细胞系及regorafenib处理的表达数据
GSE149131 是一个来自 NCBI GEO 的基因表达谱数据集，标题为“Expression data from cholangiocarcinoma cell lines and regorafenib treatment”，即胆管癌细胞系及 regorafenib 处理的表达数据。该数据集以 GPL570 平台对人类（9606）样本进行表达谱芯片检测，共包含 1 个数据文件 GSE149131_series_matrix.txt.gz。数据集由 Yu-Chan，Chang 提交，发布时间为 Apr 22 202，主题标签涵盖 Expression profiling by array、GPL570 与 9606，本站将其归入肿瘤 / 其他分类。整体而言，该数据集围绕胆管癌细胞系在 regorafenib 处理条件下的表达变化展开，可用于了解该药物对胆管癌细胞转录组的影响。
【数据集背景】
该数据集关注胆管癌细胞系以及 regorafenib 处理后的基因表达变化。源站描述指出，研究展示 regorafenib 处理抑制了多条经典通路和转录因子，说明该数据集的核心背景是考察 regorafenib 在胆管癌细胞中对信号通路与转录调控的影响。数据集标题直接点明样本来源为胆管癌细胞系，并涉及 regorafenib 处理，因此其设计意图与药物处理后的表达谱比较相关。关于研究的具体背景细节、实验假设及更完整的生物学动机，源站未提供。
【数据内容】
数据集包含 1 个文件，文件样例为 GSE149131_series_matrix.txt.gz，属于表达谱芯片数据。主题标签显示其数据类型为 Expression profiling by array，平台为 GPL570，物种为人类（9606）。从标题与源站描述可知，数据内容应涉及胆管癌细胞系在 regorafenib 处理条件下的表达测量结果，但具体样本数量、分组方式、基因数量及差异表达结果等细节，源站未提供。文件以 GZIP 压缩包形式提供，需解压后读取其中的 series matrix 文本内容。
【采集与来源】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，即 NCBI GEO 数据库，作者为 Yu-Chan，Chang，发布时间为 Apr 22 202。数据通过表达谱芯片平台 GPL570 对人类样本进行检测，样本类型为胆管癌细胞系，并涉及 regorafenib 处理。关于样本采集的具体流程、细胞系名称、处理浓度与时间、实验批次等信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于胆管癌相关转录组研究，尤其是关注 regorafenib 处理对胆管癌细胞基因表达、经典通路及转录因子影响的场景。由于采用表达谱芯片平台且物种为人类，可用于与同类芯片表达数据进行比较分析，或作为药物处理表达变化的参考数据。也可用于方法学上的数据读取与字段核对练习。关于该数据集是否适用于特定临床研究、药物敏感性预测或通路富集分析的具体结论，源站未提供。
【使用方法】
使用时可先下载数据文件 GSE149131_series_matrix.txt.gz，按 GZIP 压缩包格式解压并读取其中的 series matrix 文本。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入分析流程。由于数据集仅包含 1 个文件，读取时应关注矩阵中的样本信息与表达值组织方式。关于具体的分析步骤、标准化方法或推荐软件，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集仅包含 1 个文件，数据规模与样本组成信息有限。源站描述仅概括性地指出 regorafenib 处理抑制多条经典通路和转录因子，未提供具体的统计指标、差异基因列表或验证结果。数据集基于表达谱芯片平台 GPL570，其分辨率与定量特性受平台本身限制。关于样本量、重复数、批次效应、数据质量控制指标等，源站未提供。使用时应注意这些限制，避免过度解读。
【引用与许可】
该数据集的作者为 Yu-Chan，Chang，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，发布时间为 Apr 22 202。关于该数据集的引用方式、许可协议及使用限制，源站未提供。使用者在引用或再分发数据前，应自行查阅源站的相关说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE149131
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们证明，瑞戈非尼治疗抑制了多种经典通路和转录因子。我们使用微阵列分析来探究瑞戈非尼调控基因表达的潜在机制。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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