神经元释放丝氨酸支持胰腺癌mRNA翻译数据集

该数据集来自NCBI GEO(GSE139910),包含PATU-8902胰腺癌细胞系在添加或不添加400μM丝氨酸和400μM甘氨酸条件下培养24小时后获得的总RNA和核糖体保护片段测序数据

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基因组回归GPL203019606
GSE139910: Neurons Release Serine to Support mRNA Translation in Pancreatic Cancer

基本信息

模态
基因组
任务类型
回归
创建/更新时间
2026-11-05

资源简介

神经元释放丝氨酸支持胰腺癌mRNA翻译数据集

Neurons Release Serine to Support mRNA Translation in Pancreatic Cancer

该数据集来自NCBI GEO(GSE139910),包含PATU-8902胰腺癌细胞系在添加或不添加400μM丝氨酸和400μM甘氨酸条件下培养24小时后获得的总RNA和核糖体保护片段测序数据。数据通过高通量测序进行表达谱分析,可用于研究神经元释放的丝氨酸如何支持胰腺癌mRNA翻译,涉及肿瘤代谢与翻译调控的关联分析(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Nov 04 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):在本数据集中,我们纳入了从PATU-8902细胞系获得的总片段和核糖体保护片段的测序数据,这些细胞系在DMEM(2.78mM葡萄糖、4mM谷氨酰胺、1mM丙酮酸)+ 10%透析FBS + 1% Pen/Strep中培养,添加或不添加400uM Ser和400uM Gly,培养24小时。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL20301、9606。本站分类:肿瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE139910

【使用注意】

· 源站最后修改于 Feb 01 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在本数据集中,我们纳入了从PATU-8902细胞系获得的测序数据,包括总片段和核糖体保护片段。这些细胞系在含2.78mM葡萄糖、4mM谷氨酰胺、1mM丙酮酸的DMEM培养基中培养,添加了10%透析胎牛血清和1%青霉素/链霉素,并在有无400μM丝氨酸和400μM甘氨酸的条件下处理24小时。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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