神经元释放丝氨酸支持胰腺癌mRNA翻译数据集
该数据集来自NCBI GEO(GSE139910),包含PATU-8902胰腺癌细胞系在添加或不添加400μM丝氨酸和400μM甘氨酸条件下培养24小时后获得的总RNA和核糖体保护片段测序数据

基本信息
资源简介
神经元释放丝氨酸支持胰腺癌mRNA翻译数据集
Neurons Release Serine to Support mRNA Translation in Pancreatic Cancer
该数据集来自NCBI GEO(GSE139910),包含PATU-8902胰腺癌细胞系在添加或不添加400μM丝氨酸和400μM甘氨酸条件下培养24小时后获得的总RNA和核糖体保护片段测序数据。数据通过高通量测序进行表达谱分析,可用于研究神经元释放的丝氨酸如何支持胰腺癌mRNA翻译,涉及肿瘤代谢与翻译调控的关联分析(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Nov 04 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):在本数据集中,我们纳入了从PATU-8902细胞系获得的总片段和核糖体保护片段的测序数据,这些细胞系在DMEM(2.78mM葡萄糖、4mM谷氨酰胺、1mM丙酮酸)+ 10%透析FBS + 1% Pen/Strep中培养,添加或不添加400uM Ser和400uM Gly,培养24小时。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL20301、9606。本站分类:肿瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE139910
【使用注意】
· 源站最后修改于 Feb 01 202,引用时请注意版本时效。
下载信息
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
在本数据集中,我们纳入了从PATU-8902细胞系获得的测序数据,包括总片段和核糖体保护片段。这些细胞系在含2.78mM葡萄糖、4mM谷氨酰胺、1mM丙酮酸的DMEM培养基中培养,添加了10%透析胎牛血清和1%青霉素/链霉素,并在有无400μM丝氨酸和400μM甘氨酸的条件下处理24小时。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




