小鼠胰腺癌组织基因表达分析数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE139357

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

为考察环境风险因素对胰腺癌发生的影响，我们给对照组Pdx1-Cre（WT）和Pdx1-Cre; Kras-flox（Kras）小鼠喂食含高胆固醇、高饱和脂肪及3.5%酒精的西方酒精饮食，持续5个月。为增强酒精诱导的胰腺损伤，我们在饮食中添加了低剂量脂多糖（LPS，1 μg/ml）。小鼠还在第1至第4个月期间接受角叉菜胶（50 μg/kg）每小时注射一次、连续7次，共4轮。为模拟吸烟，我们在第1至第4个月期间注射烟草来源的致癌物4-(甲基亚硝胺基)-1-(3-吡啶基)-1-丁酮（NNK，100 mg/kg），共4次。从Pdx1-Cre（n=3，正常）和Pdx1-Cre; Kras-flox（n=6，全部）小鼠中采集胰腺组织。Kras-flox（Kras）小鼠还分别喂食常规饲料（n=3，对照）或3.5%酒精饮食（N=3，酒精）5个月。RNA-seq分析显示，这些风险因素在胰腺癌组织中诱导了癌症相关基因的表达。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。