淋巴管肌瘤病细胞鉴定及其子宫起源

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE135851

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

淋巴管肌瘤病（LAM）是一种发生于育龄期女性的转移性肿瘤，可导致囊性肺重塑和进行性呼吸衰竭。虽然已知LAM病灶中含有异常的平滑肌样细胞，这些细胞携带TSC1或TSC2中的mTOR激活突变，但侵入肺部的突变“LAM细胞”的组织来源仍不清楚。通过对离体LAM肺组织进行单细胞和单核RNA测序，我们鉴定出一个独特的细胞群体及其相关的特征基因和基因网络，这些特征易于与内源性肺细胞相区分。这些独特的LAMCORE细胞在转录组水平上与正常子宫最为相似，并与神经嵴共享转录组特征，这一点通过单核RNA测序在子宫LAM病灶中得到确认。免疫荧光显微镜证实了LAMCORE细胞特征基因在肺和子宫LAM病灶中的表达。血清适配体蛋白质组学和ELISA鉴定出了与LAMCORE细胞所表达并预测可分泌的特征基因相一致的生物标志物。

单细胞转录组学强烈支持LAMCORE细胞的子宫神经嵴起源；这为疾病发病机制提供了见解，并为LAM的未来治疗策略提供了依据。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。