肿瘤细胞异质性指导成纤维细胞多样性与互惠信号传导 [数据集 1]
该数据集来自 NCBI GEO（GSE135433），研究小鼠胰腺肿瘤亚克隆在与成纤维细胞共培养后基因表达的变化，涉及肿瘤细胞异质性对成纤维细胞多样性和互惠信号传导的影响
![GSE135433: Tumour Cell Heterogeneity Instructs Fibroblast Diversity and Reciprocal Signalling [dataset 1]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/141315_v20261105002305.jpg)
基本信息
资源简介
肿瘤细胞异质性指导成纤维细胞多样性与互惠信号传导 [数据集 1]
GSE135433（数据集 1）来自 NCBI GEO，标题为“Tumour Cell Heterogeneity Instructs Fibroblast Diversity and Reciprocal Signalling [dataset 1]”，聚焦肿瘤细胞异质性如何影响成纤维细胞的多样性以及两者之间的互惠信号传导。该数据集以小鼠胰腺肿瘤为研究对象，考察 8 个鼠源胰腺肿瘤亚克隆在与成纤维细胞共培养后基因表达发生的变化，属于表达谱分析类数据，采用高通量测序技术获取转录组层面的表达信息。数据集由 Amy McCarthy 提交，发布时间为 2019 年 8 月 6 日，在本站归类为肿瘤 / 其他，包含 1 个数据文件，样例文件为 GSE135433_series_matrix.txt.gz。整体而言，该数据集为研究肿瘤细胞异质性驱动的微环境细胞分化与细胞间通讯提供了可用的表达谱资源。
【数据集背景】
肿瘤并非均一的细胞群体，同一肿瘤内部的不同亚克隆在基因表达和表型上可能存在显著差异，这种异质性会影响肿瘤微环境中其他细胞类型的行为。成纤维细胞是肿瘤微环境的重要组成成分，肿瘤细胞与成纤维细胞之间的相互作用被认为在肿瘤进展中发挥关键作用。该数据集围绕“肿瘤细胞异质性指导成纤维细胞多样性及互惠信号传导”这一主题，通过将 8 个鼠源胰腺肿瘤亚克隆与成纤维细胞共培养，观察共培养条件下基因表达的变化，从而为理解肿瘤细胞亚克隆差异如何影响成纤维细胞状态及双方信号交流提供数据基础。
【数据内容】
数据集的核心内容是 8 个鼠源胰腺肿瘤亚克隆在与成纤维细胞共培养后的基因表达变化信息。数据以表达谱形式组织，属于高通量测序产生的表达谱分析数据。数据集仅包含 1 个文件，样例文件名为 GSE135433_series_matrix.txt.gz，该文件为 GZIP 压缩格式，通常用于承载系列层面的表达矩阵及样本注释信息。主题标签涉及表达谱分析、高通量测序平台 GPL19057 以及物种编号 10090（小鼠），表明数据来源于小鼠样本并在特定测序平台上产生。数据的具体样本数量、分组设计、测序深度、表达值类型等细节，源站未提供。
【采集与来源】
数据来源于 NCBI GEO（ncbi.nlm.nih.gov），登录号为 GSE135433，标题为“Tumour Cell Heterogeneity Instructs Fibroblast Diversity and Reciprocal Signalling [dataset 1]”。源站描述说明，研究考察了 8 个鼠源胰腺肿瘤亚克隆在与成纤维细胞共培养后基因表达的变化。数据集作者为 Amy McCarthy，发布时间为 2019 年 8 月 6 日。数据在本站归类为肿瘤 / 其他。关于样本采集的具体方法、共培养实验的条件与时长、测序建库策略、生物学重复设置等信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肿瘤微环境与细胞间通讯相关的研究场景，尤其是关注肿瘤细胞异质性对成纤维细胞多样性影响的分析。研究者可利用该表达谱数据比较不同胰腺肿瘤亚克隆在共培养条件下的转录组差异，探索肿瘤细胞与成纤维细胞之间的互惠信号传导机制。此外，该数据也可用于小鼠胰腺肿瘤相关表达谱的验证性分析、候选基因或通路的筛选，以及作为肿瘤—基质相互作用研究的参考数据。由于数据仅涉及表达谱层面，不包含临床信息或药物处理信息，其适用场景应限定在转录组表达分析范围内。具体可支持的统计比较与生物学推断，需依据实际数据内容确定，源站未提供相关说明。
【使用方法】
使用该数据集时，可先下载数据文件 GSE135433_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩包，读取前需先解压，再按文本矩阵格式解析。建议先在小样本上核对字段与编码，确认样本标识、基因标识、表达值类型及缺失值表示方式无误后，再批量接入后续分析流程。分析时可结合主题标签中给出的测序平台信息（GPL19057）与物种信息（小鼠，10090）进行注释匹配。由于数据集仅含 1 个文件，使用时应确认该文件是否包含完整的表达矩阵与样本注释；若需原始测序数据或更详细的样本信息，源站未提供相关说明。
【质量与限制】
该数据集来自 NCBI GEO 公共数据库，具备明确的登录号、标题、作者与发布时间，数据来源可追溯。数据集仅包含 1 个文件，文件样例为 GSE135433_series_matrix.txt.gz，数据规模相对有限。源站描述仅说明研究了 8 个鼠源胰腺肿瘤亚克隆与成纤维细胞共培养后的基因表达变化，未提供样本重复数、测序质量指标、数据过滤与标准化方法等信息，因此无法对数据质量作出进一步评估。此外，数据集标题标注为“dataset 1”，可能属于系列数据的一部分，但源站未提供其他相关数据集的信息。使用者在分析前应自行核查数据完整性、表达值分布与注释一致性。
【引用与许可】
该数据集的作者为 Amy McCarthy，发布时间为 2019 年 8 月 6 日，来源站为 NCBI GEO，登录号为 GSE135433。使用该数据集时，应引用源站标题“Tumour Cell Heterogeneity Instructs Fibroblast Diversity and Reciprocal Signalling [dataset 1]”及对应登录号。关于数据的具体许可条款、使用限制与再分发规定，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE135433
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们研究了8个小鼠胰腺肿瘤亚克隆在与成纤维细胞共培养后的基因表达变化。肿瘤是复杂的生态系统，其中表型多样的肿瘤细胞嵌入在异质性细胞环境中。利用肿瘤内异质性的体外模型，我们展示了克隆性肿瘤细胞群体与基质成纤维细胞建立不同的相互作用，从而扩大肿瘤和基质细胞群体的表型多样性。异质性细胞间的相互作用驱动肿瘤细胞相互信号通路的不同参与，导致MAPK信号传导中细胞自主性差异的正常化，但AKT信号传导的多样化。因此，肿瘤细胞克隆表现出不同的细胞自主性和非细胞自主性依赖。这些结果表明，肿瘤-基质相互作用放大了肿瘤细胞自主性多样性，并且我们现有的关于肿瘤细胞异质性的观点低估了功能多样性。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
