人类与小鼠膀胱单细胞转录组图谱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE129845

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

正常人类膀胱的全面细胞解剖学对于探究良性膀胱疾病和膀胱癌的细胞起源至关重要。膀胱的生理功能及病理变化与其细胞类型密切相关。为了探究膀胱细胞的分类及其潜在功能，我们对来自人类膀胱的12，423个细胞和小鼠膀胱的12，884个细胞进行了单细胞RNA测序（scRNA seq）。在此，我们展示了人类和小鼠膀胱的单细胞转录组图谱，包括人类膀胱细胞的16个集群和小鼠膀胱细胞的15个集群。我们的研究比较并分析了人类与小鼠之间的同源性和异质性，表明人类和小鼠在进化过程中既有保守性也有异质性。我们还发现了两种新型的人类膀胱细胞；一种类型是ADRA2A+和HRH2+间质细胞，可能与神经传导和过敏反应有关；另一种类型是TNNT1+上皮细胞，其生物学功能可能与其他上皮细胞不同。

总体而言，这项分析为发现新型细胞类型、特异性转录因子、信号受体及基因数据集提供了资源，将有助于我们研究细胞类型与疾病之间的关系。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。