GSE127250：CALR Ins5与Del52突变损害表达CALR突变体的K562细胞的未折叠蛋白与氧化应激反应

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE127250

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数据说明

约30-40%的JAK2和MPL未突变的原发性血小板增多症和原发性骨髓纤维化患者中已报道存在钙网蛋白（CALR）的体细胞突变。CALR是一种内质网（ER）分子伴侣，负责蛋白质的正确折叠和钙保留。近期数据表明，TPO受体（MPL）对于CALR突变驱动的骨髓增殖性肿瘤（MPN）的发生至关重要。然而，CALR突变体的确切作用机制尚未完全阐明。在本研究中，我们显示CALR突变体损害了对内质网应激的应答能力，并降低了未折叠蛋白反应（UPR）促凋亡通路的激活。此外，我们的数据表明CALR突变诱导对氧化应激的敏感性增加，导致氧化性DNA损伤增加。我们最终证明，CALR突变细胞中OXR1的下调可能是介导突变CALR所致氧化应激敏感性增加的分子机制之一。总之，我们的数据揭示了与MPL激活协同参与CALR介导的细胞转化的新机制。

CALR突变体负面影响细胞应对氧化应激的能力，导致基因组不稳定，并影响细胞对ER应激的反应能力，从而引起对UPR诱导的细胞凋亡的抵抗。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。