VenomSeq:25种毒液作用于IMR-32细胞
该数据集来自 NCBI,记录了 25 种粗制毒液对人 IMR-32 神经母细胞瘤细胞的扰动效应,采用高通量测序进行表达谱分析

基本信息
资源简介
VenomSeq:25种毒液作用于IMR-32细胞
VenomSeq - 25 venoms vs. IMR-32
该数据集来自 NCBI,记录了 25 种粗制毒液对人 IMR-32 神经母细胞瘤细胞的扰动效应,采用高通量测序进行表达谱分析。数据用于评估 VenomSeq 转录组数据分析流程,并作为该流程产出的首个数据集。通过与 Connectivity Map 团队及其他疾病或药物暴露背景下遗传扰动公开数据的比较,可用于发现毒液与特定治疗作用之间的新关联。数据集含 1 个文件,样例为 GSE126575_series_matrix.txt.gz,物种为 9606,平台为 GPL20301(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Feb 14 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):我们报告了25种粗制毒液对人IMR-32(神经母细胞瘤)细胞的扰动效应。这些数据用于评估VenomSeq转录组数据分析流程,并提供该流程生成的第一个数据集。通过与Connectivity Map团队发布的数据以及疾病或药物暴露背景下其他免费的遗传扰动数据源进行比较,我们利用这些数据发现了毒液与特定治疗作用之间的若干新关联。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL20301、9606。本站分类:肿瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE126575
【使用注意】
· 源站最后修改于 Sep 14 202,引用时请注意版本时效。
下载信息
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
我们报告了25种粗制蛇毒对人IMR-32(神经母细胞瘤)细胞的扰动效应。这些数据用于评估VenomSeq转录组数据分析工作流程,并提供该工作流程生成的第一个数据集。通过与Connectivity Map团队发布的数据以及疾病或药物暴露背景下其他免费的遗传扰动数据源进行比较,我们利用这些数据发现了蛇毒与特定治疗作用之间的若干新关联。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




