JIB-04在Ewing肉瘤中 deregulates 致癌程序并增加DNA损伤的基因表达谱

该数据集来自NCBI GEO,包含Ewing肉瘤研究中JIB-04(pan-Jumonji结构域组蛋白去甲基化酶小分子抑制剂)处理后的高通量测序表达谱数据,共1个文件(GSE119832_series_matrix.txt.gz)

geo
浏览 4
基因组分类GPL203019606
GSE119832: The Jumonji-domain histone demethylase inhibitor JIB-04 deregulates oncogenic programs and increases DNA damage in Ewing Sarcoma, resulting in impaired cell proliferation and survival, and reduced tumor growth

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-30

资源简介

JIB-04在Ewing肉瘤中 deregulates 致癌程序并增加DNA损伤的基因表达谱

The Jumonji-domain histone demethylase inhibitor JIB-04 deregulates oncogenic programs and increases DNA damage in Ewing Sarcoma, resulting in impaired cell proliferation and survival, and reduced tumor growth

该数据集来自NCBI GEO,包含Ewing肉瘤研究中JIB-04(pan-Jumonji结构域组蛋白去甲基化酶小分子抑制剂)处理后的高通量测序表达谱数据,共1个文件(GSE119832_series_matrix.txt.gz)。数据可用于分析JIB-04对Ewing肉瘤细胞基因表达程序的影响、DNA损伤相关通路变化以及细胞增殖与存活相关机制,为研究该抑制剂在儿童骨与软组织肿瘤中的活性与作用机制提供转录组层面的数据支持(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Sep 11 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):本研究的总体目标是表征pan-Jumonji结构域组蛋白去甲基化酶小分子抑制剂JIB-04在儿童骨与软组织肿瘤Ewing肉瘤中的活性及作用机制。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL20301、9606。本站分类:肿瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE119832

【使用注意】

· 源站最后修改于 Mar 21 201,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE119832

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究的总体目标是表征泛Jumonji结构域组蛋白去甲基化酶小分子抑制剂JIB-04在儿童骨与软组织肿瘤尤文肉瘤中的活性及作用机制。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。