富马酸水合酶缺陷小鼠囊性肾上皮组织表达数据

该数据集为富马酸水合酶(FH)缺陷小鼠囊性肾上皮组织的基因表达谱数据,来源于 NCBI GEO(GSE10989),包含 1 个系列矩阵文件

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基因组分类Expression profiling by arrayGPL126110090
GSE10989: Expression data of cystic renal epithelial tissue from mice deficient for fumarate hydratase.

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-27

资源简介

富马酸水合酶缺陷小鼠囊性肾上皮组织表达数据

Expression data of cystic renal epithelial tissue from mice deficient for fumarate hydratase.

该数据集为富马酸水合酶(FH)缺陷小鼠囊性肾上皮组织的基因表达谱数据,来源于 NCBI GEO(GSE10989),包含 1 个系列矩阵文件。研究通过条件性灭活小鼠肾小管上皮细胞中的 Fh1 基因构建 HLRCC 体内模型,该模型可重现肾囊肿形成及缺氧诱导因子 α 和 Hif 靶基因过表达等特征。数据可用于分析 FH 缺陷相关肾囊肿的转录组变化,辅助研究 HLRCC 的发病机制与候选标志物(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Mar 31 200。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):富马酸水合酶(FH)突变导致遗传性平滑肌瘤病和肾细胞癌(HLRCC)。我们条件性灭活了小鼠肾小管上皮细胞中的鼠源直系同源基因(Fh1),以构建 HLRCC 的体内模型。Fh1 敲除小鼠重现了 HLRCC 的重要特征,包括肾囊肿的发生,这些囊肿过表达缺氧诱导因子 α(Hifa)和 Hif 靶基因。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL1261、10090。本站分类:肿瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE10989

【使用注意】

· 源站最后修改于 Feb 11 201,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

延胡索酸水合酶(FH)突变可导致遗传性平滑肌瘤病和肾细胞癌(HLRCC)。我们条件性灭活了肾小管上皮细胞中的小鼠同源基因(Fh1),以建立HLRCC的体内模型。Fh1敲除小鼠重现了HLRCC的重要特征,包括肾囊肿的发生,且囊肿过表达缺氧诱导因子α(Hifa)及Hif靶基因。我们使用微阵列技术详细描绘了Fh1敲除小鼠囊肿发生背后的全局基因表达程序,并鉴定了该过程中不同类别的上调基因。关键词:基因表达,比较(野生型n=3 vs 敲除型n=3)

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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