非吸烟者与无癌症吸烟者气道上皮体细胞突变的大克隆
该数据集来自 NCBI GEO,标题为“非吸烟者与无癌症吸烟者气道上皮体细胞突变的大克隆”,包含 1 个文件(GSE107772_series_matrix.txt.gz),主题标签涉及高通量测序表达谱分析、平台 GPL16791 和物种 9606

基本信息
资源简介
非吸烟者与无癌症吸烟者气道上皮体细胞突变的大克隆
GSE107772 数据集来自 NCBI GEO,标题为“非吸烟者与无癌症吸烟者气道上皮体细胞突变的大克隆”,聚焦于无癌症人群气道上皮中的体细胞突变克隆。该数据集归类于肿瘤/其他方向,包含 1 个文件,即 GSE107772_series_matrix.txt.gz,主题标签涉及高通量测序表达谱分析、平台 GPL16791 和物种 9606(人类)。数据集作者为 Juan L Rodriguez-Flores,发布时间为 2017 年 12 月 6 日。整体而言,该数据集面向气道上皮在吸入性外源物质暴露背景下体细胞突变与表达谱特征的研究,适合作为相关肿瘤学与呼吸系统研究的参考数据。
【数据集背景】
人类气道上皮持续暴露于吸入性外源物质的应激之下,这些暴露具有诱导体细胞突变的潜在可能。该数据集围绕非吸烟者与无癌症吸烟者气道上皮中的体细胞突变大克隆展开,标题明确指向“无癌症”人群,说明其关注的是癌症发生之前的体细胞突变积累现象,而非已确诊肿瘤样本。这一背景使该数据集在探讨吸烟等环境暴露与气道上皮基因组改变之间的关系方面具有参考价值。
【数据内容】
数据集包含 1 个文件,文件样例为 GSE107772_series_matrix.txt.gz,采用 GZIP 压缩格式。主题标签包括“Expression profiling by high throughput sequencing”,表明数据涉及高通量测序表达谱分析;平台标签为 GPL16791;物种标签为 9606,对应人类。文件以 series matrix 形式组织,通常用于汇总系列层面的样本与表达信息。除上述文件与标签信息外,源站未提供更细化的字段说明。
【采集与来源】
该数据集来源于 NCBI GEO(ncbi.nlm.nih.gov),源站标题与数据集英文名一致。作者为 Juan L Rodriguez-Flores,发布时间为 2017 年 12 月 6 日。源站描述指出,人类气道上皮持续暴露于吸入性外源物质的应激之下,并具有诱导体细胞突变的潜在可能。关于具体样本采集地点、受试者数量、测序平台运行参数等细节,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于气道上皮体细胞突变与表达谱相关的研究场景,例如比较非吸烟者与无癌症吸烟者之间的突变克隆特征,或作为高通量测序表达谱分析的参考数据。其“无癌症”定位使其可用于癌症发生早期阶段的研究探索。由于主题标签涉及高通量测序表达谱分析,也可用于方法学层面的数据读取与处理练习。具体分析场景应结合源站信息进一步确认,源站未提供明确的推荐用途。
【使用方法】
使用时可先下载数据文件 GSE107772_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入,以避免因格式或编码问题导致批量处理错误。由于数据集仅包含 1 个文件,读取流程相对简单,但仍应遵循先验证后批量的原则。关于文件内部具体字段含义与解析方式,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集文件数量为 1,数据规模与样本构成信息有限,源站未提供样本量、测序深度、质控指标等质量相关信息。主题标签中的平台 GPL16791 与物种 9606 可用于确认数据的技术与物种归属,但源站未提供更详细的质量评估结论。使用时应注意数据集仅覆盖非吸烟者与无癌症吸烟者气道上皮,结论外推需谨慎。源站未提供其他限制说明。
【引用与许可】
该数据集的作者为 Juan L Rodriguez-Flores,发布时间为 2017 年 12 月 6 日,来源站为 NCBI GEO。关于引用格式与许可条款,源站未提供。使用时应遵循 NCBI GEO 的相关数据使用政策,具体许可信息需另行查阅源站。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE107772
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
人类气道上皮持续暴露于吸入的外源性物质所带来的应激之中,这些物质具有诱导体细胞突变的潜力。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




