致癌KRAS在结肠癌中差异mRNA加工的作用
该数据集来自NCBI GEO,标题为致癌KRAS在结肠癌中差异mRNA加工的作用,包含1个文件GSE107605_series_matrix.txt.gz,属于高通量测序表达谱数据,物种为人类(9606),平台为GPL16791

基本信息
资源简介
致癌KRAS在结肠癌中差异mRNA加工的作用
GSE107605 是一个来自 NCBI GEO 的高通量测序表达谱数据集,标题为“Role of differential mRNA processing by oncogenic KRAS in colon cancer”,聚焦致癌 KRAS 在结肠癌中对 mRNA 差异加工的作用。该数据集由 Matteo、Forloni 提交,发布时间为 Dec 01 201,物种为人类(9606),测序平台为 GPL16791,主题标签属于 Expression profiling by high throughput sequencing。数据集共包含 1 个文件,即 GSE107605_series_matrix.txt.gz,以 GZIP 压缩格式提供,属于肿瘤 / 其他分类下的表达谱数据资源,可供研究者下载后按文件格式读取并开展分析。
【数据集背景】
该数据集围绕致癌 KRAS 在结肠癌发生过程中的作用展开。源站描述指出,致癌 KRAS 会诱导差异基因表达并导致肿瘤发生;该研究进一步探讨致癌 KRAS 是否诱导选择性 mRNA 加工,以及这种加工变化是否参与肿瘤发生。由此可知,数据集所对应的研究关注点不仅是 KRAS 引起的基因表达变化,还包括 mRNA 加工层面的差异,属于结肠癌分子机制研究中的表达谱数据资源。
【数据内容】
数据集包含 1 个文件,文件样例为 GSE107605_series_matrix.txt.gz,格式为 GZIP 压缩包。主题标签显示其为高通量测序表达谱数据,物种为人类(9606),平台为 GPL16791。除上述文件与平台、物种信息外,源站未提供关于样本数量、分组设计、具体基因列表或加工事件类型的更多细节。
【采集与来源】
数据来源于 NCBI GEO,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。数据集标题与源站标题一致,均为“Role of differential mRNA processing by oncogenic KRAS in colon cancer”。作者为 Matteo、Forloni,发布时间为 Dec 01 201。数据通过高通量测序获得表达谱信息,平台编号为 GPL16791。其余采集方法、实验流程与样本来源信息源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于肿瘤特别是结肠癌相关研究中的表达谱分析,可用于考察致癌 KRAS 相关的差异基因表达与 mRNA 加工变化。由于主题标签为 Expression profiling by high throughput sequencing,其典型用途包括表达谱数据的读取、整理与比较分析,以及围绕 KRAS 信号与 mRNA 加工关系的探索性研究。具体分析设计需结合源站信息确定,源站未提供更细化的适用说明。
【使用方法】
使用时可先下载数据文件 GSE107605_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入,以保证后续分析的一致性与可重复性。源站未提供额外的预处理步骤、标准化方法或分析脚本说明。
【质量与限制】
数据集仅包含 1 个文件,属于系列矩阵文件,源站未提供样本层面的质控指标、重复数或批次信息。由于缺少这些细节,使用时应自行核对数据完整性与字段含义。该数据集为表达谱数据,是否足以支持 mRNA 加工层面的结论需结合原始研究设计判断,源站未提供相关验证信息。
【引用与许可】
引用时应参考 NCBI GEO 源站提供的引用要求,作者信息为 Matteo、Forloni。许可与使用条款源站未提供,使用前应查阅源站相关说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE107605
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Oncogenic KRAS induces differential gene expression leading to oncogenesis. Here we investigate if oncogenic KRAS induces alternate mRNA processing which contributes to oncogenesis.
数据缺失?
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