真性红细胞增多症和原发性血小板增多症中CALR和JAK2突变相关的基因和miRNA表达谱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE103238

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数据说明

真性红细胞增多症（PV）和原发性血小板增多症（ET）是费城染色体阴性的骨髓增殖性肿瘤（MPN），分别以红细胞增多和血小板增多为特征。约95%的PV患者和50%–70%的ET患者携带JAK2基因第14外显子的V617F突变，而约20%–30%的ET患者携带CALRins5或CALRdel52突变。与JAK2突变患者相比，这些CALR突变的ET患者表现出更高的血小板计数和更低的血栓形成风险。本研究发现，CALR突变型和JAK2V617F阳性的CD34+细胞具有不同的基因和miRNA表达谱。事实上，我们重点揭示了JAK2V617F突变与CALR突变祖细胞之间差异激活的若干通路，即mTOR、MAPK/PI3K和MYC通路。此外，我们还发现，CALR突变细胞中参与DNA修复、染色质重塑、剪接和染色单体黏连的若干基因表达降低。与CALR突变患者血栓形成风险较低相一致，我们还发现参与凝血酶信号传导和血小板活化的若干基因表达下调。

总体而言，这些数据支持这样一个模型：CALR突变的ET可被视为与JAK2V617F阳性的MPNs不同的独立疾病实体，并可能为支持这些患者不同临床特征的分子基础提供依据。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。