野生型HEC-50B与MAPK14敲除HEC-50B细胞二维单层和三维球体培养的全局蛋白质组与磷酸化蛋白质组分析

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD053011

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

高级别子宫内膜癌(HGEC)转移性生长和存活的分子基础尚不清楚。本研究表明，腹水来源和原发肿瘤HGEC细胞系在3D球体培养中忠实地再现了恶性腹膜积液的关键特征，并且与传统的2D单层培养相比，展现出根本不同的转录组、蛋白质组和代谢组景观。利用遗传筛选平台，我们确定MAPK14(编码蛋白激酶p38a)是HGEC在球体培养中的特异性需求。MAPK14/p38a在编程HGEC球体的磷酸化蛋白质组中具有广泛作用，但对单层培养的影响微乎其微。通过全局蛋白质组和磷酸化蛋白质组分析，我们鉴定出几种在3D球体中特异性激活的激酶。球体培养引起的磷酸化蛋白丰度最大幅度的增加和减少均依赖于MAPK14。因此，MAPK14在确定球体培养中HGEC细胞的全局激酶组方面发挥着关键作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。