胰腺导管腺癌全基因组DNA甲基化图谱

资源简介

胰腺导管腺癌全基因组DNA甲基化图谱

该数据集聚焦胰腺导管腺癌（PDAC）的全基因组DNA甲基化模式，来源于 omicsdi.org，归类于肿瘤/其他方向。研究通过 Infinium 450k 甲基化芯片（Illumina）对 167 例 PDAC 肿瘤样本与 29 例癌旁非肿瘤胰腺组织进行全基因组甲基化检测，旨在刻画 PDAC 的甲基化图谱。数据集以转录组学为主题标签，可为探索胰腺肿瘤的表观遗传改变提供样本层面的数据基础。

【数据集背景】

胰腺导管腺癌是胰腺最常见的恶性肿瘤类型，其分子特征的研究对于理解疾病发生发展具有重要意义。DNA 甲基化作为一种重要的表观遗传修饰，在基因表达调控中发挥关键作用。该数据集正是围绕 PDAC 的甲基化模式展开，通过全基因组层面的分析，系统性地考察肿瘤组织与癌旁非肿瘤组织之间的甲基化差异，为后续的表观遗传研究提供数据支撑。

【数据内容】

数据集包含两类样本的甲基化检测数据：167 例胰腺肿瘤（PDAC）样本和 29 例癌旁非肿瘤样本。检测平台为 Illumina Infinium 450k 甲基化芯片，该平台可覆盖全基因组范围内的甲基化位点。数据以肿瘤与癌旁组织的对照形式组织，便于开展差异甲基化分析。主题标签为转录组学，提示数据可用于与基因表达相关的关联研究。

【采集与来源】

数据来源于 omicsdi.org。样本采集自胰腺导管腺癌患者队列，包括肿瘤组织与相邻的非肿瘤胰腺组织，样本总量为 167 例肿瘤加 29 例癌旁组织。检测采用 Infinium 450k 甲基化芯片完成，属于全基因组甲基化分析。关于样本的具体采集地点、时间跨度、伦理审批等信息，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于胰腺导管腺癌甲基化模式的探索性研究，包括肿瘤与癌旁组织间的差异甲基化分析、甲基化图谱的刻画，以及与转录组学数据的整合分析。由于主题标签涉及转录组学，数据也可用于考察甲基化改变与基因表达调控之间的潜在关联。此外，该数据可作为 PDAC 表观遗传研究的参考数据集，用于方法学验证或与其他队列的比较研究。

【使用方法】

使用时可依据样本分组信息，将 167 例肿瘤样本与 29 例癌旁样本进行对照比较，开展差异甲基化位点与区域的识别。分析前需对芯片数据进行相应的预处理与标准化。由于肿瘤与癌旁样本数量不平衡，在统计比较时应考虑样本量差异带来的影响。具体的数据格式、预处理流程与配套分析工具，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集基于 Infinium 450k 芯片，覆盖范围受平台位点设计所限。样本构成上，肿瘤样本数量明显多于癌旁样本，可能影响组间比较的统计效能。关于样本的临床信息、随访数据、批次效应及质控指标等，源站未提供。使用者在解释结果时需注意这些潜在限制。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式与使用许可，源站未提供。使用前建议查阅 omicsdi.org 上的原始条目以获取相关信息。