胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤(IPMN)基因表达谱
该数据集来自 omicsdi.org，为胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤（IPMN）的基因表达谱数据，整合了 23 例 IPMN 组织的微阵列表达数据，其中高风险 17 例、低风险 6 例
基本信息
资源简介
胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤(IPMN)基因表达谱
该数据集为胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤（IPMN）的基因表达谱数据，来源于 omicsdi.org，主题归类为转录组学，本站分类为肿瘤 / 其他。其核心内容是整合 23 例 IPMN 组织的微阵列表达数据，其中高风险样本 17 例、低风险样本 6 例，用于探索特定 miRNA 候选靶基因在高风险与低风险 IPMN 组织之间是否存在差异表达。该数据集面向胰腺肿瘤分子机制与生物标志物方向的转录组研究，可为研究者比较不同病理风险等级 IPMN 组织的基因表达特征提供数据基础。
【数据集背景】
该数据集围绕胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤（IPMN）的分子特征展开。研究目的在于探索某些 miRNA 的候选靶基因在高风险与低风险 IPMN 组织之间是否呈现差异表达。在此前的一项预研项目中，研究者已识别出能够区分经病理确认的高风险（浸润性和高级别）与低风险（低级别和中级别）IPMN 组织的 miRNA。本数据集即在此基础上，进一步考察已被证明受这些 miRNA 调控的基因靶标的表达情况，从而将 miRNA 层面的发现延伸到其下游靶基因的表达层面，形成从调控分子到靶基因表达的连贯研究思路。
【数据内容】
数据集的主体是 23 例 IPMN 组织的微阵列表达数据，按病理风险等级划分为高风险 17 例与低风险 6 例。数据内容聚焦于基因表达谱，主题标签为转录组学。其分析指向是特定 miRNA 候选靶基因的表达水平比较，即在高风险与低风险两组组织之间考察这些靶基因是否存在差异表达。样本数量与分组结构构成了该数据集的基本规模特征，高风险组样本数明显多于低风险组。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org，英文名称为 Gene expression profiling of intraductal papillary mucinous neoplasms (IPMNs) of the pancreas。数据来自 IPMN 组织的微阵列表达检测，样本按病理确认的风险等级进行分组。关于样本采集的具体时间、地点、机构、伦理审批信息以及微阵列平台型号等细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于胰腺 IPMN 相关的转录组学研究，尤其是围绕 miRNA 靶基因差异表达的分析。典型用途包括：比较高风险与低风险 IPMN 组织之间候选靶基因的表达差异；验证预研中识别的 miRNA 与其靶基因在组织表达层面的对应关系；为 IPMN 风险分层相关的分子标志物探索提供表达谱数据支持。其主题标签为转录组学，适合基因表达谱分析类的研究任务。
【使用方法】
使用时可依据高风险（17 例）与低风险（6 例）的分组对微阵列表达数据进行组间比较，围绕特定 miRNA 的候选靶基因开展差异表达分析。由于数据集的核心目的是考察这些靶基因在两组之间的表达差异，分析设计应围绕靶基因集合展开，而非全基因组范围的无差别筛选。关于数据文件格式、预处理步骤、归一化方法及统计分析流程等具体操作细节，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为预研后续的小规模研究，共纳入 23 例 IPMN 组织样本，其中低风险组仅 6 例，两组样本量不平衡。数据基于微阵列表达检测，分析范围聚焦于特定 miRNA 的候选靶基因。关于样本的临床注释完整度、随访信息、数据质控指标以及批次效应等信息，源站未提供。使用者在解释组间差异时需考虑样本规模与分组结构的上述特点。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、原始发表文献、数据许可协议及使用条款等信息，源站未提供。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-63104
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
探讨特定miRNA的候选靶基因在高风险与低风险IPMN组织中是否存在差异表达。通过一个试点项目，我们鉴定了能够区分病理确诊的高风险（浸润性和高级别）与低风险（低级别和中级别）IPMN组织的miRNA。利用当前数据集，我们通过整合23例IPMN（17例高风险；6例低风险）的微阵列表达数据，探索了已被证实受所鉴定miRNA调控的靶基因的表达情况。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
