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创建/更新时间

2026-10-28

资源简介

两种Ewing肉瘤细胞系（SK-N-MC、TC-71）诱导性重新表达TCF7L1或Empty对照的基因表达数据

该数据集聚焦于尤文肉瘤（Ewing sarcoma）研究中的基因表达层面，收录了两种尤文肉瘤细胞系SK-N-MC与TC-71的基因表达数据。这两种细胞系均经过转染处理，以实现TCF7L1的诱导性重新表达，或以Empty载体作为对照。数据集英文名称为“Gene expression of two Ewing sarcoma cell lines (SK-N-MC, TC-71), transfected with inducible re-expression of TCF7L1 or Empty control”，在来源站omicsdi.org上归入肿瘤/其他类别，主题标签为Genomics。整体而言，该数据集为研究TCF7L1在尤文肉瘤细胞中的表达调控作用提供了以两种细胞系为背景、含诱导性重新表达与空载体对照的基因表达数据资源，适合用于转录组层面的比较分析。

【数据集背景】

尤文肉瘤是一种以基因表达调控异常为研究重点的肿瘤类型，细胞系模型是解析其分子机制的重要工具。该数据集围绕TCF7L1这一基因在尤文肉瘤细胞中的重新表达展开，采用诱导性表达策略，使研究者能够在受控条件下观察TCF7L1表达变化对细胞基因表达谱的影响。数据集同时纳入SK-N-MC与TC-71两种细胞系，并以Empty载体转染作为对照，从而在两种遗传背景中形成“诱导性重新表达”与“对照”的配对比较设计。这一设计使数据集具备研究TCF7L1功能与尤文肉瘤转录组响应之间关系的潜在价值。

【数据内容】

数据集的核心内容是两种尤文肉瘤细胞系SK-N-MC与TC-71在转染条件下的基因表达数据。转染处理分为两类：一是TCF7L1的诱导性重新表达，二是Empty载体对照。由此，数据覆盖了两种细胞系与两种转染条件的组合，形成可供比较的基因表达谱集合。主题标签为Genomics，表明数据属于基因组学范畴，具体表现为基因表达层面的测量结果。数据集的英文名称与源站描述一致，均明确指出了细胞系名称、转染方式以及TCF7L1与Empty对照这两个关键实验条件。

【采集与来源】

该数据集来源于omicsdi.org，在来源站上归入肿瘤/其他分类。源站描述与数据集英文名称相同，均说明其内容为两种尤文肉瘤细胞系经诱导性TCF7L1重新表达或Empty对照转染后的基因表达数据。关于具体的实验平台、测序或芯片类型、样本数量、生物学重复数、培养条件、转染试剂与诱导方案等采集细节，源站未提供。

【适用场景】

基于现有信息，该数据集适用于以下方向：尤文肉瘤细胞系中TCF7L1重新表达对基因表达谱影响的比较分析；SK-N-MC与TC-71两种细胞系在相同转染条件下的转录组差异探讨；以Empty载体为对照，识别与TCF7L1诱导性表达相关的表达变化模式；以及作为尤文肉瘤基因组学研究的辅助数据资源，用于假设生成或与其他表达数据集的整合分析。由于主题标签为Genomics，其应用场景主要落在基因表达与转录调控研究范围内。

【使用方法】

使用该数据集时，可依据细胞系（SK-N-MC、TC-71）与转染条件（TCF7L1诱导性重新表达、Empty对照）两个维度组织样本分组，开展组间比较。分析时应将TCF7L1重新表达组与对应的Empty对照组配对，并在两种细胞系中分别考察，以避免细胞系背景差异对结果的干扰。具体的预处理流程、归一化方法、差异表达分析参数以及统计阈值，源站未提供，需使用者依据数据实际格式与分析目的自行确定。

【质量与限制】

该数据集明确涉及两种细胞系与两类转染条件，但样本规模、重复设置、测序深度或芯片覆盖度、数据质控指标等信息源站未提供，因此无法对数据质量作出具体评价。此外，数据集仅涵盖基因表达层面，不包含蛋白水平、功能验证或临床信息。使用者在解释结果时需注意细胞系模型的局限性，以及诱导性重新表达体系与内源表达之间的潜在差异。相关实验条件与批次信息源站未提供，可能影响跨数据集比较的可靠性。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、作者信息、发表文献、版本号以及使用许可条款，源站未提供。使用者在引用或再分发前，应自行查阅来源站omicsdi.org上的原始条目以获取准确的引用与许可信息。

原始链接

https://omicsdi.org/dataset/project/PRJNA698592

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使用方式

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/project/PRJNA698592

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Gene expression of two Ewing sarcoma cell lines (SK-N-MC, TC-71), transfected with inducible re-expression of TCF7L1 or Empty control

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别