两株尤文肉瘤细胞系(SK-N-MC、RDES)转染可诱导shControl或两种靶向PRC1的shRNA后的基因表达
该数据集来自omicsdi.org,收录两种Ewing肉瘤细胞系SK-N-MC与RDES的基因表达数据,细胞分别转染可诱导的shControl或两种不同的靶向PRC1的shRNA

基本信息
资源简介
两株尤文肉瘤细胞系(SK-N-MC、RDES)转染可诱导shControl或两种靶向PRC1的shRNA后的基因表达
该数据集收录两种Ewing肉瘤细胞系SK-N-MC与RDES的基因表达数据,细胞分别转染可诱导的shControl或两种不同的靶向PRC1的shRNA。数据集英文名称为“Gene expression of two Ewing sarcoma cell lines (SK-N-MC, RDES), transfected with inducible shControl or two different shRNA against PRC1”,在来源站omicsdi.org中被归入肿瘤/其他分类,主题标签为Genomics。整体来看,该数据集围绕Ewing肉瘤细胞系中PRC1的敲低实验展开,通过可诱导的shRNA系统比较对照组与两个不同PRC1靶向shRNA组的基因表达情况,为研究PRC1在Ewing肉瘤中的表达调控作用提供转录组层面的数据基础。
【数据集背景】
Ewing肉瘤是一种肿瘤类型,本数据集所属分类为肿瘤/其他。数据集聚焦于两种Ewing肉瘤细胞系SK-N-MC与RDES,采用可诱导的shControl或两种不同的靶向PRC1的shRNA进行转染,从而获得不同处理条件下的基因表达数据。该设计的核心在于通过RNA干扰方式靶向PRC1,并设置对照组,以便在基因表达层面观察PRC1敲低所带来的转录变化。数据集的英文名称直接概括了细胞系、转染方式与靶向基因等关键实验要素。
【数据内容】
数据集的内容为两种Ewing肉瘤细胞系SK-N-MC与RDES的基因表达数据。细胞分别转染可诱导的shControl或两种不同的靶向PRC1的shRNA,因此数据覆盖对照与两种PRC1敲低条件。主题标签为Genomics,表明数据属于基因组学范畴。关于具体的基因数量、样本数量、表达值格式、测序平台或芯片平台等信息,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于omicsdi.org,源站描述与数据集英文名称一致,均为“Gene expression of two Ewing sarcoma cell lines (SK-N-MC, RDES), transfected with inducible shControl or two different shRNA against PRC1”。数据集的分类为肿瘤/其他,主题标签为Genomics。关于样本采集的具体流程、实验操作细节、数据处理步骤等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于围绕Ewing肉瘤细胞系中PRC1功能展开的基因表达研究,例如比较shControl与两种靶向PRC1的shRNA处理组之间的转录组差异,观察PRC1敲低对SK-N-MC与RDES两种细胞系基因表达的影响。由于涉及两种细胞系与两种不同shRNA,也可用于考察不同细胞系背景或不同shRNA序列条件下表达变化的一致性与差异性。此外,该数据集可作为基因组学相关分析的材料,用于探索PRC1在Ewing肉瘤中的表达调控相关研究。具体分析类型与适用范围源站未提供。
【使用方法】
数据集以基因表达数据形式提供,使用时可依据转染条件将样本划分为可诱导的shControl组与两种靶向PRC1的shRNA组,并在SK-N-MC与RDES两种细胞系之间进行比较分析。关于数据文件格式、下载方式、预处理流程与标准化方法等,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集仅涉及两种Ewing肉瘤细胞系SK-N-MC与RDES,实验条件为可诱导的shControl或两种不同的靶向PRC1的shRNA转染。关于数据质量评估、批次效应、重复数量、测序深度或表达定量准确性等信息,源站未提供。使用时应结合具体研究目的谨慎解释结果,相关质量指标与限制说明源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式与许可信息,源站未提供。
下载信息
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公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
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使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/project/PRJNA658340
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Gene expression of two Ewing sarcoma cell lines (SK-N-MC, RDES), transfected with inducible shControl or two different shRNA against PRC1
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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