两种Ewing肉瘤细胞系（A-673、EW-22）诱导型GLRX3 shRNA转导后的基因表达数据

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两种Ewing肉瘤细胞系（A-673、EW-22）诱导型GLRX3 shRNA转导后的基因表达数据

该数据集收录了两种Ewing肉瘤细胞系（A-673与EW-22）在诱导型shRNA敲低GLRX3基因后的转录组数据，共包含10个样本。数据经标准化处理（log2转换），采用Affymetrix Expression Console Software（v1.4）中的SST-RMA算法完成归一化，并借助Clariom D芯片（人类）对应的Affymetrix注释库在基因水平上进行了注释。数据集归属于肿瘤/其他类别，主题标签为转录组学，来源于omicsdi.org。整体而言，该数据集围绕GLRX3基因敲低这一实验条件，提供了两种Ewing肉瘤细胞系在转录组层面的表达谱信息，可用于考察该基因扰动对细胞基因表达格局的影响。

【数据集背景】

Ewing肉瘤是一种肿瘤类型，本数据集聚焦于该肿瘤的两种细胞系A-673与EW-22。研究设计采用诱导型shRNA对GLRX3基因进行敲低，从而在转录组水平观察基因表达的变化。数据集的主题标签为转录组学，所属分类为肿瘤/其他，说明其面向肿瘤相关转录组研究。

【数据内容】

数据集包含两种Ewing肉瘤细胞系（A-673和EW-22）在诱导型shRNA敲低GLRX3基因后的转录组数据，共10个样本。样本经过标准化处理，以log2形式呈现，并使用SST-RMA算法完成归一化。基因表达数据在基因水平上进行了注释，所依据的是Clariom D芯片（人类）对应的Affymetrix注释库。

【采集与来源】

该数据集来源于omicsdi.org。源站描述表明，数据为上述两种细胞系在GLRX3敲低后的转录组数据，共10个样本，经Affymetrix Expression Console Software（v1.4）以SST-RMA算法归一化（log2），并利用Clariom D芯片（人类）的Affymetrix库完成基因水平注释。其余采集细节源站未提供。

【适用场景】

基于其转录组学主题与GLRX3敲低的实验设计，该数据集适用于考察GLRX3基因表达下调后两种Ewing肉瘤细胞系基因表达谱变化的分析场景，例如比较敲低前后基因水平的表达差异、研究该基因扰动相关的转录组响应等。具体应用方向源站未提供。

【使用方法】

使用时可依据数据集中经log2标准化并以SST-RMA算法归一化的基因水平表达数据开展分析；由于数据已在基因水平完成注释，可直接基于注释后的基因表达信息进行后续处理。样本共10个，涉及A-673与EW-22两种细胞系在诱导型shRNA敲低GLRX3条件下的转录组。其他使用说明源站未提供。

【质量与限制】

数据经Affymetrix Expression Console Software（v1.4）以SST-RMA算法归一化，并在基因水平使用Clariom D芯片（人类）的Affymetrix库注释，具备相应的处理流程记录。样本量为10个，涉及两种细胞系。关于数据质量评估、批次信息、重复设置及潜在局限，源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供。