JAK2V617F阳性MPN患者与健康对照的CD34+ BMMCs/PBMCs基因表达数据
该数据集来自omicsdi.org,收录JAK2V617F突变阳性的费城染色体阴性骨髓增殖性肿瘤(MPN)患者与健康供者CD34+细胞的基因表达数据,样本涵盖骨髓或外周血单核细胞

基本信息
资源简介
JAK2V617F阳性MPN患者与健康对照的CD34+ BMMCs/PBMCs基因表达数据
该数据集收录了JAK2V617F突变阳性的费城染色体阴性骨髓增殖性肿瘤(MPN)患者与健康供者CD34+细胞的基因表达数据,样本来源涵盖骨髓(BM)或外周血(PB)单核细胞。数据集英文名称为“Gene expression data from CD34+ BMMCs/PBMCs from JAK2V617F positive MPN patients vs. Healthy controls”,在来源站点的分类中归入肿瘤/其他,主题标签为转录组学(Transcriptomics),数据由omicsdi.org收录。其核心设计是在JAK2V617F突变患者与健康供者之间开展CD34+细胞基因表达的比较,为研究MPN中该驱动突变相关的转录组改变提供数据基础。
【数据集背景】
费城染色体阴性骨髓增殖性肿瘤(MPN)包括原发性骨髓纤维化(PMF)、真性红细胞增多症(PV)、原发性血小板增多症(ET)以及继发性骨髓纤维化(pPV-MF或pET-MF)。JAK2V617F是这类疾病中常见的突变。该数据集正是围绕JAK2V617F突变阳性患者与健康供者之间的基因表达差异而构建,比较对象为骨髓或外周血单核细胞中的CD34+细胞。
【数据内容】
数据集提供的是基因表达数据,属于转录组学范畴,比较的是JAK2V617F突变阳性MPN患者与健康供者CD34+细胞的表达谱。样本涉及骨髓(BM)和外周血(PB)两种来源的单核细胞。除上述描述外,源站未提供具体的样本数量、基因数量、测序平台或表达定量指标等细节。
【采集与来源】
数据来源于omicsdi.org,原始描述指出该数据集比较的是JAK2V617F突变患者与健康供者骨髓或外周血单核细胞中CD34+细胞的基因表达数据。关于样本采集流程、处理步骤与测序或芯片平台等具体信息,源站未提供。
【适用场景】
该数据集可用于MPN相关转录组研究,例如比较JAK2V617F突变阳性患者与健康供者CD34+细胞之间的基因表达差异,探讨突变相关的表达改变;也可用于骨髓与外周血来源CD34+细胞表达特征的对照分析,以及PMF、PV、ET及继发性骨髓纤维化等MPN亚型背景下的表达研究。具体分析用途需结合源站未提供的样本与平台信息进一步确定。
【使用方法】
源站未提供具体的使用方法说明,包括数据下载方式、文件格式、预处理流程与分析建议等。
【质量与限制】
源站未提供关于数据质量、批次效应、样本量或验证情况的信息。由于缺乏样本数量、平台与临床注释等细节,使用时应注意到这些限制。数据集名称与描述中未给出各MPN亚型的具体样本构成,相关分析需谨慎对待。
【引用与许可】
源站未提供引用方式与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/geo/GSE136335
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
费城染色体阴性骨髓增殖性肿瘤(MPN)包括原发性骨髓纤维化(PMF)、真性红细胞增多症(PV)、原发性血小板增多症(ET)以及继发性骨髓纤维化(pPV-MF或pET-MF)。在本数据集中,我们比较了JAK2V617F突变患者与健康供者骨髓(BM)或外周血(PB)单核细胞中CD34+细胞的基因表达数据。
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