原始神经外胚层肿瘤基因表达分析
该数据集来自 omicsdi.org,主题为转录组学,聚焦中枢神经系统原始神经外胚层肿瘤(CNS PNET)与髓母细胞瘤的基因表达分析

基本信息
资源简介
原始神经外胚层肿瘤基因表达分析
该数据集英文名为 Gene expression analysis of primitive neuroectodermal tumors,来源于 omicsdi.org,主题标签为转录组学,聚焦中枢神经系统原始神经外胚层肿瘤(CNS PNET)与髓母细胞瘤的基因表达分析。中枢神经系统原始神经外胚层肿瘤与髓母细胞瘤均属于胚胎性肿瘤,主要发生于儿童。该数据集利用微阵列技术对一组 CNS PNET 与髓母细胞瘤样本进行分析,旨在识别与肿瘤亚组相关的基因表达特征。从分类上看,该数据集归入肿瘤 / 其他类别,整体围绕转录组层面的基因表达研究展开,为理解这两类儿童胚胎性肿瘤的分子分型提供表达谱数据支持。
【数据集背景】
中枢神经系统原始神经外胚层肿瘤(CNS PNET)与髓母细胞瘤同属胚胎性肿瘤,且均以儿童为主要发病人群。两类肿瘤在临床与病理上存在一定相似性,如何从分子层面区分并刻画其亚组特征,是相关研究关注的问题。该数据集正是围绕这一背景,通过基因表达分析来识别与肿瘤亚组相关的表达模式,主题归属于转录组学范畴。
【数据内容】
该数据集的核心内容是针对一组 CNS PNET 与髓母细胞瘤样本的基因表达分析结果,数据由微阵列(microarrays)技术产生。其分析目标在于识别与肿瘤亚组相关的基因表达。数据集的主题标签为 Transcriptomics(转录组学),表明数据主体为转录组层面的表达信息。除上述内容外,源站未提供更细的数据内容说明。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org。根据源站描述,研究采用微阵列技术对一批 CNS PNET 与髓母细胞瘤样本进行分析,样本对象为儿童中主要发生的这两类胚胎性肿瘤。关于样本的具体数量、采集地点、采集时间及处理流程等细节,源站未提供。
【适用场景】
基于其主题与描述,该数据集适用于转录组学方向的基因表达研究,尤其是围绕 CNS PNET 与髓母细胞瘤的肿瘤亚组识别与分子特征分析。可用于比较两类胚胎性肿瘤的表达谱差异、探索与亚组相关的基因表达模式等研究场景。关于更具体的应用方向,源站未提供。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用方法,包括数据格式、下载方式、分析流程或配套工具等信息均未说明。
【质量与限制】
源站未提供关于数据质量、样本规模、平台型号、数据完整性及使用限制等方面的说明。该数据集聚焦于 CNS PNET 与髓母细胞瘤的基因表达分析,其结论与适用范围应以原始研究为准。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。
下载信息
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提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
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使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/geo/GSE19404
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
中枢神经系统原始神经外胚层肿瘤(CNS PNET)和髓母细胞瘤均为主要发生于儿童的胚胎性肿瘤。我们采用微阵列技术分析了一组CNS PNET和髓母细胞瘤样本,以识别与肿瘤亚组相关的基因表达。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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