原始神经外胚层肿瘤基因表达分析

该数据集来自 omicsdi.org,主题为转录组学,聚焦中枢神经系统原始神经外胚层肿瘤(CNS PNET)与髓母细胞瘤的基因表达分析

omicsdi
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基因组分类Transcriptomics
Gene expression analysis of primitive neuroectodermal tumors

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-28

资源简介

原始神经外胚层肿瘤基因表达分析

该数据集英文名为 Gene expression analysis of primitive neuroectodermal tumors,来源于 omicsdi.org,主题标签为转录组学,聚焦中枢神经系统原始神经外胚层肿瘤(CNS PNET)与髓母细胞瘤的基因表达分析。中枢神经系统原始神经外胚层肿瘤与髓母细胞瘤均属于胚胎性肿瘤,主要发生于儿童。该数据集利用微阵列技术对一组 CNS PNET 与髓母细胞瘤样本进行分析,旨在识别与肿瘤亚组相关的基因表达特征。从分类上看,该数据集归入肿瘤 / 其他类别,整体围绕转录组层面的基因表达研究展开,为理解这两类儿童胚胎性肿瘤的分子分型提供表达谱数据支持。

【数据集背景】

中枢神经系统原始神经外胚层肿瘤(CNS PNET)与髓母细胞瘤同属胚胎性肿瘤,且均以儿童为主要发病人群。两类肿瘤在临床与病理上存在一定相似性,如何从分子层面区分并刻画其亚组特征,是相关研究关注的问题。该数据集正是围绕这一背景,通过基因表达分析来识别与肿瘤亚组相关的表达模式,主题归属于转录组学范畴。

【数据内容】

该数据集的核心内容是针对一组 CNS PNET 与髓母细胞瘤样本的基因表达分析结果,数据由微阵列(microarrays)技术产生。其分析目标在于识别与肿瘤亚组相关的基因表达。数据集的主题标签为 Transcriptomics(转录组学),表明数据主体为转录组层面的表达信息。除上述内容外,源站未提供更细的数据内容说明。

【采集与来源】

该数据集来源于 omicsdi.org。根据源站描述,研究采用微阵列技术对一批 CNS PNET 与髓母细胞瘤样本进行分析,样本对象为儿童中主要发生的这两类胚胎性肿瘤。关于样本的具体数量、采集地点、采集时间及处理流程等细节,源站未提供。

【适用场景】

基于其主题与描述,该数据集适用于转录组学方向的基因表达研究,尤其是围绕 CNS PNET 与髓母细胞瘤的肿瘤亚组识别与分子特征分析。可用于比较两类胚胎性肿瘤的表达谱差异、探索与亚组相关的基因表达模式等研究场景。关于更具体的应用方向,源站未提供。

【使用方法】

源站未提供该数据集的具体使用方法,包括数据格式、下载方式、分析流程或配套工具等信息均未说明。

【质量与限制】

源站未提供关于数据质量、样本规模、平台型号、数据完整性及使用限制等方面的说明。该数据集聚焦于 CNS PNET 与髓母细胞瘤的基因表达分析,其结论与适用范围应以原始研究为准。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。

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源站:https://omicsdi.org/dataset/geo/GSE19404

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

中枢神经系统原始神经外胚层肿瘤(CNS PNET)和髓母细胞瘤均为主要发生于儿童的胚胎性肿瘤。我们采用微阵列技术分析了一组CNS PNET和髓母细胞瘤样本,以识别与肿瘤亚组相关的基因表达。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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