GDC TCGA-UCS:子宫癌肉瘤

疾病类型:基底细胞肿瘤、复杂混合性和间质性肿瘤;原发部位:子宫体、子宫,NOS;数据类别:简单核苷酸变异、测序读段、生物样本、临床、拷贝数变异、转录组分析、DNA甲基化、蛋白质组分析、体细胞结构变异、结构变异;子宫癌肉瘤;TCGA-UCS

gdc
浏览 11
基因组分类['Corpus uteri', 'Uterus, NOS']
GDC TCGA-UCS: Uterine Carcinosarcoma

基本信息

模态
基因组
大小
27209.568392145 GB
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-04

资源简介

GDC TCGA-UCS:子宫癌肉瘤

Uterine Carcinosarcoma

该数据集来自 GDC 的 TCGA-UCS 项目,主题为子宫癌肉瘤(Uterine Carcinosarcoma),覆盖疾病类型包括 Basal Cell Neoplasms 与 Complex Mixed and Stromal Neoplasms,原发部位涉及 Corpus uteri 与 Uterus, NOS。数据类别涵盖 Simple Nucleotide Variation、Sequencing Reads、Biospecimen、Clinical、Copy Number Variation、Transcriptome Profiling、DNA Methylation、Proteome Profiling、Somati。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):疾病类型:基底细胞肿瘤、复杂混合性和间质性肿瘤;原发部位:子宫体、子宫,NOS;数据类别:简单核苷酸变异、测序读段、生物样本、临床、拷贝数变异、转录组分析、DNA甲基化、蛋白质组分析、体细胞结构变异、结构变异;子宫癌肉瘤;TCGA-UCS

【主题与分类】

主题标签:['Corpus uteri', 'Uterus, NOS']。本站分类:肿瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://portal.gdc.cancer.gov/projects/TCGA-UCS

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使用方式

数据集获取

源站:https://portal.gdc.cancer.gov/projects/TCGA-UCS

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 27209.57 GB。

数据说明

GDC project TCGA-UCS (Uterine Carcinosarcoma). Primary site: Corpus uteri, Uterus, NOS. Disease type: Basal Cell Neoplasms, Complex Mixed and Stromal Neoplasms. Program: TCGA. Cases: 57. Files: 3,769. Total size: 25340.9 GB. NCI Genomic Data Commons harmonized cancer genomics project (clinical, biospecimen, RNA-Seq, WXS, methylation and imaging data; open and controlled access tiers).

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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