GCCRI PDX NCH-PXA1 脑星形细胞瘤

主题标签:脑星形细胞瘤、PDX模型、突变、拷贝数变异、基因表达、肿瘤。本数据集为肿瘤领域公开数据集,主题涵盖脑星形细胞瘤。

biostudies
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基因组分类脑星形细胞瘤PDX模型突变拷贝数变异基因表达肿瘤
[GCCRI] [PDX] [NCH-PXA1] Brain Astrocytoma

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-31

资源简介

GCCRI PDX NCH-PXA1 脑星形细胞瘤

该数据集英文名称为 [GCCRI] [PDX] [NCH-PXA1] Brain Astrocytoma,在来源站点 ebi.ac.uk 上以 S-CMO8138 NCH-PXA1 的标识出现,属于肿瘤领域的公开数据集,本站将其归类为“肿瘤 / 其他”。数据集围绕脑星形细胞瘤(Brain Astrocytoma)这一主题构建,涉及患者来源异种移植(PDX)模型,并涵盖突变、拷贝数变异与基因表达等分子层面信息,同时关联相关出版物。数据集由 UT Health San Antonio Greehey Children's Cancer Research 相关机构提供,托管于 EMBL-EBI,并可通过 PIVOT 与 preclinicalpivot.org 等渠道关联获取。以下依据可获得的信息,从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制以及引用与许可等方面进行介绍。

【数据集背景】

该数据集的主题为脑星形细胞瘤,属于肿瘤研究范畴。脑星形细胞瘤是起源于星形胶质细胞的一类中枢神经系统肿瘤,在儿童与成人中均有发生,相关研究通常关注其分子特征与治疗模型。数据集名称中包含 PDX 标识,表明其与患者来源异种移植模型相关;名称中的 NCH-PXA1 与 GCCRI 等标识用于区分具体的模型或研究项目。来源站将其描述为 Brain Astrocytoma PDX,说明该资源以脑星形细胞瘤的 PDX 模型为核心对象,服务于肿瘤基础与转化研究。

【数据内容】

依据来源站描述,该数据集涉及的数据类型包括突变(mutation)、拷贝数变异(copy number alteration)与表达(expression)信息,并关联出版物(publication)。主题标签涵盖脑星形细胞瘤、PDX 模型、突变、拷贝数变异、基因表达与肿瘤。数据集名称中包含 NCH-PXA1 这一模型标识,提示其围绕特定 PDX 模型组织数据。除上述类型外,样本数量、具体基因列表、变异位点、表达矩阵的规模与格式等细节,源站未提供。

【采集与来源】

数据集托管于 EMBL-EBI,来源站为 ebi.ac.uk,源站描述中标注了 EMBL-EBI 及其使用条款页面。数据提供方标注为 UT Health San Antonio Greehey Children's Cancer Research。数据集可通过 preclinicalpivot.org 与 PIVOT 关联访问。关于样本采集的具体流程、伦理审批信息、测序或检测平台、数据处理管线等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集可用于脑星形细胞瘤的分子特征研究,例如考察突变与拷贝数变异情况、分析基因表达特征,以及结合 PDX 模型开展肿瘤建模与临床前研究。由于涉及 PDX 模型,其潜在用途还包括围绕患者来源模型进行药物反应或转化研究的数据参照。具体适用场景需结合源站与相关出版物进一步确认;清单未提及的特定分析用途,源站未提供。

【使用方法】

数据集可通过来源站 ebi.ac.uk 访问,并可通过 preclinicalpivot.org 与 PIVOT 渠道关联获取。使用时应遵循 EMBL-EBI 的使用条款。关于数据下载格式、文件组织方式、配套分析工具或 API 等,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为公开资源,来源站标注了使用条款与提供机构信息。关于数据完整性、样本量、质控指标、批次效应或验证情况等质量相关信息,源站未提供。使用者在开展分析前应自行评估数据适用性。

【引用与许可】

数据集来源站为 ebi.ac.uk,托管方为 EMBL-EBI,使用需遵循其使用条款(https://www.ebi.ac.uk/about/terms-of-use)。数据集关联有出版物,但具体的文献引用信息、作者列表与许可条款细节,源站未提供。

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源站:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/S-CMO8138

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

S-CMO8138 NCH-PXA1 [GCCRI] [PDX] [NCH-PXA1] Brain Astrocytoma PDX Brain Astrocytoma N/A mutation copy number alteration expression publication Yes https://preclinicalpivot.org/ PIVOT No EMBL-EBI https://www.ebi.ac.uk/about/terms-of-use UT Health San Antonio Greehey Children’s Cancer Research

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