荷瘤L2-Cre;p120f/f小鼠CD38high与CD38low CD11b+Gr1+脾细胞表达数据

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-71705

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

髓源性抑制细胞（MDSCs）是一种免疫抑制性的未成熟髓系细胞群体，存在于晚期癌症患者和小鼠肿瘤模型中。我们已经发现Cd38基因可能在MDSC生物学中发挥重要作用。为了确定来自荷瘤小鼠的CD38高表达和CD38低表达MDSCs之间的差异，我们进行了这项微阵列分析。在本数据集中，我们纳入了从荷瘤L2-Cre;p120f/f小鼠分选获得的脾脏CD38高表达CD11b+Gr1+细胞与同一小鼠的CD38低表达CD11b+Gr1+细胞的表达数据比较。利用这些数据，我们检测到498个基因的差异表达。Nos2基因是CD38高表达MDSCs中上调最显著的基因之一。共分析了8个样本：3对CD38高表达和CD38低表达MDSCs（来自个体小鼠），以及一对混合的CD38高表达和CD38低表达MDSCs（将3只小鼠的脾细胞混合后进行分选以提高产量）。基因表达差异通过单变量检验（双样本t检验）结合多变量置换检验（10，000次随机置换）确定。

采用小于0.001的p值截断值和至少2倍的表达变化来识别两组之间表达差异显著的基因。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。