人类肠道与唾液微生物群生物样本库的建立——肾脏疾病

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT04689074

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

疾病：常染色体显性多囊肾病（ADPKD）、晚期慢性肾脏病（CKD）、糖尿病肾病（DKD）、IgA肾病（IgAN）。这项多中心研究的主要目的是建立首个全国性微生物组生物样本库，收集慢性肾脏病受试者（IgAN、ADPKD、晚期CKD和DKD）及健康志愿者的生物样本（粪便、唾液、尿液和血液样本）。次要目的是利用元组学、体外和体内方法对生物样本库中的微生物进行表征，并研究微生物群与病理之间的关系。该研究计划根据纳入/排除标准，在巴里综合医院和佩鲁贾大学招募150名受试者。研究参与是自愿的，受试者有权在任何时候以任何理由退出研究。

研究期间，计划进行3次访问：

• 访问0（V0），包括研究目的和程序的说明、签署书面知情同意书、纳入/排除标准评估、医学检查（血压测量、腹部和胸部体格检查）、填写病史问卷、发放用于收集粪便、唾液和尿液材料的试剂盒（需在访问1时提交），以及发放3天饮食日记，需在访问1前几日自行完成填写。

• 访问1（V1）——至少在V0后4天进行，包括提交收集的生物材料（粪便、唾液、尿液）和3天饮食日记，填写新的体征和症状病史问卷，以及由医务人员进行血液采样。

• 电话评估：实施“食物频率问卷”，以评估受试者的饮食习惯。

将采用标准操作程序（SOP）进行样本的储存、运输和处理，以确保样本稳定性，并保证结果的有效性和质量。

采集完成后，样本将被处理成不同的等分试样，用于以下用途：* 常规筛查；* 储存于首个意大利人类微生物群生物样本库（I.R.C.C.S. - Istituto Tumori "Giova

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。