脑膜瘤患者来源类器官的建立与表征

该数据集来自 clinicaltrials.gov,围绕脑膜瘤患者来源类器官的建立与表征,计划在 1 年内完成患者招募与类器官培养,研究人群为 30 例

Chinese University of Hong KongChinese University of Hong Kong
clinicaltrials
浏览 3
基因组Meningioma
Establishment and Characterization of Meningioma Patient-derived Organoids

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-28

资源简介

脑膜瘤患者来源类器官的建立与表征

该数据集英文名为 Establishment and Characterization of Meningioma Patient-derived Organoids,来源于 clinicaltrials.gov,本站归类为肿瘤 / 其他,主题标签为脑膜瘤(Meningioma)。数据集围绕脑膜瘤患者来源类器官的建立与表征展开,研究者提出的假设是:所衍生的类器官应具有与患者原发组织相似的形态学和基因突变特征。研究计划用 1 年时间完成患者招募及从患者肿瘤生成类器官,研究人群为 30 例,样本取自因手术需要而采集的脑膜瘤肿瘤组织,用于类器官培养,并比较患者肿瘤样本与相应衍生类器官之间的形态学和遗传特征。主要结局指标为患者肿瘤组织及患者来源类器官的全外显子组测序数据。

【数据集背景】

脑膜瘤是本研究关注的核心疾病。该数据集所对应的研究旨在建立并表征脑膜瘤患者来源类器官,其出发点是验证一个明确的研究假设:衍生出的类器官应当在形态学与基因突变特征上与患者原发组织保持相似。围绕这一假设,研究设定了患者招募与类器官生成的周期,并明确了研究人群规模与样本来源方式。整体来看,该数据集服务于脑膜瘤类器官模型构建及其与原始肿瘤组织一致性的验证这一研究目标。

【数据内容】

数据集的核心内容围绕患者肿瘤组织与患者来源类器官的配对比较展开。根据源站描述,研究将比较患者肿瘤样本与相应衍生类器官之间的形态学特征和遗传特征。主要结局指标为患者肿瘤组织及患者来源类器官的全外显子组测序数据,这意味着数据内容涉及两类样本的全外显子组测序结果,并以此支撑基因突变特征层面的比较。形态学特征的具体指标、测序数据的格式与规模等细节,源站未提供。

【采集与来源】

样本来源于因手术需要而接受治疗的脑膜瘤患者的肿瘤组织,采集后用于类器官培养。研究计划在 1 年内完成患者招募以及从患者肿瘤生成类器官的工作,研究人群为 30 例。数据来源站为 clinicaltrials.gov。除上述信息外,样本采集的具体机构、采集时间窗口的起止日期、伦理审批信息等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于脑膜瘤患者来源类器官模型的建立与表征研究,尤其适合用于评估类器官与原发肿瘤组织在形态学和基因突变特征上的一致性。基于全外显子组测序数据,可用于比较肿瘤组织与对应类器官的遗传特征。此外,也可作为脑膜瘤类器官培养流程与配对样本研究设计的参考。需要说明的是,清单未提及该数据集在其他疾病或其它类型肿瘤中的适用性,相关外推应谨慎。

【使用方法】

源站描述中明确的主要结局指标为患者肿瘤组织与患者来源类器官的全外显子组测序数据,因此使用时可围绕配对样本的测序数据进行组织与类器官之间的比较分析,并结合形态学特征开展一致性评估。关于数据访问方式、下载格式、分析流程、软件工具及具体操作步骤,源站未提供。

【质量与限制】

该研究设定了 1 年的患者招募与类器官生成周期,研究人群为 30 例,样本来自因手术需要而采集的脑膜瘤肿瘤组织。研究假设聚焦于类器官与原发组织在形态学和基因突变特征上的相似性,主要结局指标为配对样本的全外显子组测序数据。关于样本质量评估标准、测序深度、数据完整性、缺失情况以及研究的偏倚控制等信息,源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供引用方式与许可信息。该数据集来源于 clinicaltrials.gov,使用时应遵循源站的相关规定;具体引用格式与使用许可条款,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://clinicaltrials.gov/study/NCT04478877

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件:脑膜瘤。待检验的目的与假设:研究者假设,所衍生的类器官应具有与患者原发组织相似的形态学和基因突变特征。研究期限:1年,用于患者招募及从患者肿瘤生成类器官。研究人群:30。研究样本:从有手术需求的患者中采集患者的脑膜瘤肿瘤样本。采集的样本用于类器官培养。将比较患者肿瘤样本与相应衍生类器官之间的形态学和遗传特征。主要结局指标:患者肿瘤组织和患者衍生类器官的全外显子组测序数据

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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