口腔癌与口腔白斑患者样本的表观基因组分析

资源简介

口腔癌与口腔白斑患者样本的表观基因组分析

该数据集聚焦于口腔癌与口腔白斑患者样本的表观基因组分析，围绕全基因组DNA甲基化谱展开。研究队列共纳入48名患者，涵盖对照组、口腔白斑患者和口腔癌患者三类人群，采用Infinium MethylationEPIC BeadChip 850K芯片对DNA甲基化变化进行检测。数据集英文名称为“Epigenome analysis of samples from oral cancer and oral leukoplakias patients”，在来源站归入肿瘤/其他分类，主题标签为转录组学。整体而言，该数据集提供了口腔癌及癌前病变口腔白斑患者在基因组范围内甲基化修饰层面的检测数据，可用于探索两类病变在表观遗传层面的差异与联系，为理解口腔癌发生发展中的甲基化改变提供数据基础。

【数据集背景】

口腔癌是发生于口腔部位的恶性肿瘤，口腔白斑则属于口腔黏膜的癌前病变，两者在临床与生物学上存在密切关联。DNA甲基化作为一种重要的表观遗传修饰，在基因表达调控、细胞分化及肿瘤发生过程中发挥关键作用。该数据集正是针对口腔癌与口腔白斑患者样本开展全基因组DNA甲基化谱分析，旨在从表观遗传角度刻画两类病变的甲基化特征。数据集来源站为omicsdi.org，主题标签为转录组学，本站分类归入肿瘤/其他。

【数据内容】

该数据集的核心内容是口腔癌与口腔白斑患者样本的全基因组DNA甲基化谱数据。检测采用Infinium MethylationEPIC BeadChip 850K芯片，对DNA甲基化变化进行全基因组范围的 interrogate（检测）。研究队列共48名患者，包括对照组、口腔白斑患者和口腔癌患者。数据覆盖上述三类人群的甲基化检测结果，可用于比较不同组别之间的甲基化差异。关于具体样本量在各组间的分配、检测位点数量、数据文件格式与规模等信息，源站未提供。

【采集与来源】

数据集来源于omicsdi.org。样本采集自口腔癌与口腔白斑患者，并设有对照组，队列总计48名患者。检测平台为Infinium MethylationEPIC BeadChip 850K芯片，用于检测DNA甲基化变化。关于样本采集的具体机构、采集时间、伦理审批信息以及样本处理流程等细节，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于口腔癌与口腔白斑的表观遗传学研究，可用于探索两类病变在DNA甲基化层面的差异模式，识别与口腔癌发生发展相关的甲基化改变；也可用于癌前病变向恶性肿瘤演进过程中表观遗传机制的研究。此外，该数据可作为口腔癌分子标志物筛选、甲基化谱比较分析等研究的参考数据。关于具体的分析应用案例或已验证的用途，源站未提供。

【使用方法】

使用该数据集时，可基于Infinium MethylationEPIC BeadChip 850K芯片产生的甲基化数据进行组间比较分析，考察对照组、口腔白斑患者与口腔癌患者之间的甲基化差异。关于数据下载方式、文件组织格式、预处理流程及分析工具等具体使用说明，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集队列规模为48名患者，涵盖对照组、口腔白斑患者和口腔癌患者三类人群，采用850K甲基化芯片进行检测。关于数据质量评估指标、缺失值情况、批次效应控制以及样本分组的具体人数等信息，源站未提供。使用时应结合源站提供的原始描述与数据文件自行评估适用性。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式与许可信息，源站未提供。