食管癌患者唾液样本的表观遗传芯片数据（含对照）

资源简介

食管癌患者唾液样本的表观遗传芯片数据（含对照）

该数据集为食管癌相关唾液样本的表观遗传芯片数据，英文名称为“Epigenetic array data of saliva samples in individiduals with esophageal cancer (with controls)”，来源于omicsdi.org，主题标签为“Methylation profiling”，即甲基化谱分析。数据集涵盖23例浸润性食管腺癌患者、25例黏膜内食管腺癌患者、35例非异型增生Barrett食管患者以及32例对照个体，对照者在内镜检查中未发现Barrett食管或癌症。所有唾液样本均在空腹至少1小时后采集，且内镜检查在采样2周内完成。该数据集旨在对此前 deposited 于GEO数据库（登录号GSE232332）的同类批次研究进行进一步验证，但与前一数据集不同的是，本数据集尚未提交发表。整体而言，该数据集为食管癌及Barrett食管相关的唾液表观遗传学研究提供了样本层面的甲基化谱数据资源。

【数据集背景】

该数据集是对此前已存入基因表达综合数据库（GEO）、登录号为GSE232332的同类批次数据的进一步验证性研究。源站描述明确指出，本数据集的目的在于对前述研究进行进一步验证。与前一数据集不同的是，本数据集尚未提交发表。数据集聚焦于食管癌及癌前病变——Barrett食管——人群的唾液样本表观遗传特征，属于肿瘤领域中“其他”分类下的甲基化谱分析数据。其设计涵盖从浸润性食管腺癌、黏膜内食管腺癌、非异型增生Barrett食管到内镜阴性对照的连续疾病谱，为探索唾液甲基化标志物在食管腺癌及其癌前状态中的表现提供了样本基础。

【数据内容】

数据集包含的表观遗传数据来自四组个体：23例浸润性食管腺癌患者、25例黏膜内食管腺癌患者、35例非异型增生Barrett食管患者，以及32例在内镜检查中未发现Barrett食管或癌症的对照个体。数据主题标签为“Methylation profiling”，表明其核心数据类型为甲基化谱。源站描述未提供具体的芯片平台、探针数量、甲基化位点覆盖范围、数据文件格式及单个样本的数据量等细节。除样本分组与例数外，源站未提供关于临床变量（如年龄、性别、吸烟史等）的进一步信息。

【采集与来源】

所有唾液样本均在受试者空腹至少1小时后采集。内镜检查在唾液采样后2周内完成，对照组的判定依据即为该次内镜检查未发现Barrett食管或癌症。样本来源为接受内镜检查的个体，涵盖食管腺癌患者、Barrett食管患者及内镜阴性对照。数据来源于omicsdi.org。源站未提供样本采集的具体地点、采集时间跨度、样本处理与保存流程、DNA提取方法及芯片实验的具体操作细节。

【适用场景】

基于其样本构成与甲基化谱主题，该数据集可用于食管腺癌及Barrett食管相关唾液表观遗传标志物的验证性研究，例如比较不同疾病阶段（浸润性癌、黏膜内癌、非异型增生Barrett食管与对照）之间的甲基化谱差异，或作为此前GSE232332研究的独立验证资源。主题标签“Methylation profiling”表明其适用于甲基化谱分析类研究。源站未提供该数据集在其他具体应用场景中的使用说明或验证结论。

【使用方法】

源站未提供该数据集的具体使用说明，包括数据下载方式、文件组织格式、预处理流程、质量控制步骤及分析工具建议等。使用者需依据omicsdi.org上该数据集的原始页面获取进一步的操作信息。

【质量与限制】

该数据集尚未提交发表，源站描述中未提供同行评议或正式发表的质量评估信息。样本量方面，各组例数分别为23、25、35和32例，源站未提供效能分析或样本量合理性说明。源站未提供数据质量控制指标、批次效应信息、缺失值情况或技术重复信息。此外，该数据集为验证性研究，源站未提供其验证结果或与GSE232332比较的结论。使用时应考虑其未发表状态及源站未提供的相关质量信息。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式、许可协议或使用条款。使用者应参考omicsdi.org上该数据集原始页面的相关信息。源站未提供数据访问权限或再分发条件的说明。