食管鳞状细胞癌全外显子组测序样本数据集
该数据集来自 omicsdi.org,收录食管鳞状细胞癌(ESCC)相关样本,源站描述显示研究对中国患者开展了 71 例全外显子组测序

基本信息
资源简介
食管鳞状细胞癌全外显子组测序样本数据集
ena-DATASET-BGI-21-02-2016-13:06:06:458-111 - samples 是一个收录于 omicsdi.org 的肿瘤类数据集,分类归入“其他”。其主题标签为 Genomics,内容围绕食管鳞状细胞癌(ESCC)相关样本展开。源站描述指出,食管鳞状细胞癌是全球致死率最高的癌症之一,该研究对中国患者开展了 71 例全外显子组测序。数据集名称中的“samples”表明其收录对象为样本层面的数据记录。整体来看,该数据集面向食管鳞状细胞癌的基因组学研究,以中国患者队列的全外显子组测序样本为核心内容,可供关注食管癌分子特征的研究者检索与参考。
【数据集背景】
食管鳞状细胞癌(Esophageal Squamous Cell Carcinoma,ESCC)是食管癌的主要组织学类型之一,在包括中国在内的东亚地区发病率较高。源站描述强调,ESCC 是全球范围内致死性最强的癌症类型之一,这一背景构成了该数据集产生的临床与科研动因。该数据集所对应的研究聚焦中国患者群体,针对这一人群开展全外显子组测序,意在从基因组层面刻画食管鳞状细胞癌的样本特征。数据集以“samples”为后缀命名,说明其组织方式以样本为单位,而非以分析结果或汇总统计为单位,便于使用者按样本维度进行检索和整合。
【数据内容】
依据源站描述,该数据集收录的是食管鳞状细胞癌相关的样本,研究共完成 71 例全外显子组测序。全外显子组测序针对基因组中的蛋白编码区域,是肿瘤体细胞突变研究中常用的技术策略。数据集的分类为肿瘤 / 其他,主题标签为 Genomics,表明其内容属性属于基因组学范畴。除上述信息外,关于样本的具体构成、测序平台、数据文件类型、突变位点数量、临床信息字段等细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 omicsdi.org,这是一个整合多组学数据资源的索引平台,数据集通过该平台对外呈现。源站描述明确说明研究对象为中国患者,测序策略为全外显子组测序,样本规模为 71 例。关于样本采集的具体地点、机构、时间跨度、伦理审批信息以及测序服务的执行方等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集可用于食管鳞状细胞癌基因组学的探索性研究,例如面向中国患者队列的外显子组水平变异概览、样本层面的数据整合与比较分析,以及作为相关研究中的候选样本资源进行检索。由于其主题标签为 Genomics,也适合在组学数据索引与元数据研究场景中作为条目参考。需要说明的是,上述适用方向基于数据集的肿瘤基因组学属性与样本构成,具体分析可行性取决于实际可获取的数据内容,源站未提供进一步说明。
【使用方法】
该数据集通过 omicsdi.org 平台发布与检索,使用者可依据数据集名称及样本标识进行定位。关于数据下载方式、访问权限、文件格式、配套分析流程或工具等,源站未提供。
【质量与限制】
源站描述仅提及 71 例全外显子组测序及中国患者背景,未提供数据质量评估指标、质控标准、覆盖度、重复性验证等信息。数据集分类为“其他”,其具体界定依据源站未提供。使用者应注意,样本量与研究人群范围有限,结论外推需谨慎;关于数据完整性、更新频率与版本信息,源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、文献出处、许可协议与使用条款,源站未提供。使用者在引用或再利用前,应自行向数据来源平台核实相关规定。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001001926
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
食管鳞状细胞癌(ESCC)是全球最致命的癌症之一。我们对中国患者的食管鳞状细胞癌进行了71例外显子组测序。
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