EGAS00001001933-sc-2021-02-16T09:50:41Z 样本数据集

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001006969

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

到中年时，NOTCH1突变克隆占据正常人类食管的多数区域，但在食管癌中相对罕见，提示NOTCH1突变可能促进克隆扩增却阻碍癌变。本文对此假说进行验证。在衰老的正常人食管中观察并测序NOTCH1突变克隆，发现频繁存在阻断NOTCH1信号的双等位基因突变。在小鼠食管中，杂合Notch1突变赋予细胞相对于野生型细胞的竞争优势，第二个等位基因缺失会增强这一效应。Notch1缺失改变转录，但对上皮结构和细胞动力学影响甚微。在癌变模型中，Notch1突变在肿瘤中的发生率低于正常上皮。敲除Notch1可减少肿瘤生长，抗NOTCH1抗体治疗可重现该效应。我们得出结论：正常上皮中的Notch1突变有益，因为野生型Notch1促进肿瘤扩增。阻断NOTCH1在食管鳞状肿瘤中具有治疗潜力。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。