EGAS00001000518-sc-20131016 样本数据集
该数据集来自 omicsdi.org，属于肿瘤/其他分类，主题标签为 Genomics。数据针对血管肉瘤（Angiosarcoma）患者，采用定制的靶向 pulldown 实验，并对所得产物进行测序，以确定这些患者中既往已发现突变的流行情况
基本信息
资源简介
EGAS00001000518-sc-20131016 样本数据集
EGAS00001000518-sc-20131016 - samples 是一个聚焦于血管肉瘤（Angiosarcoma）的基因组学研究数据集，收录于 omicsdi.org 来源站，在本站归类为肿瘤 / 其他，主题标签为 Genomics。该数据集的核心内容围绕一项定制化的靶向 pulldown 实验展开：研究人员针对血管肉瘤患者样本实施该实验，并对实验所得产物进行测序，目的在于确定这些患者中既往已发现突变的流行情况。整体来看，该数据集属于肿瘤基因组学方向，以患者样本为对象，通过靶向富集与测序相结合的策略，探索特定突变在血管肉瘤患者群体中的分布特征，为相关研究提供样本层面的数据支撑。
【数据集背景】
血管肉瘤是一种较为罕见的肿瘤类型，其分子特征的研究对于理解疾病发生机制、寻找潜在诊疗靶点具有重要意义。该数据集正是面向这一疾病背景而设立，试图通过靶向实验与测序手段，考察既往研究中已经发现的突变在血管肉瘤患者中的出现频率与分布情况。数据集英文名中的“samples”提示其内容与样本层面相关，而“sc-20131016”这一标识可能对应样本或实验批次的时间信息，但源站未提供更具体的背景说明。该数据集的主题标签为 Genomics，表明其研究视角落在基因组学范畴，关注的是基因层面的变异信息。由于血管肉瘤本身相对少见，针对该疾病患者群体开展靶向突变流行情况的考察，有助于积累该肿瘤类型的分子流行病学资料。
【数据内容】
该数据集的内容来源于一项定制的靶向 pulldown 实验。所谓靶向 pulldown，通常指利用特定探针或捕获体系对目标基因组区域进行富集，从而将测序注意力集中在研究者关心的位点上。在本数据集中，实验对象为血管肉瘤患者，实验产物随后经过测序，以确定既往已发现突变在这些患者中的流行程度。因此，数据集所承载的信息应与这些靶向区域内的突变检测结果相关，其核心价值在于反映特定突变在血管肉瘤患者样本中的存在情况。不过，关于具体的样本数量、测序平台、目标基因列表、突变位点明细以及数据文件格式等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来自 omicsdi.org 来源站，本站将其归入肿瘤 / 其他分类。从源站描述可知，研究针对的是血管肉瘤患者，采用定制靶向 pulldown 实验并对产物进行测序。这一流程说明数据的采集依托于患者样本的分子实验，而非公共数据库的二次整合。数据集英文名中包含“EGAS00001000518”，这一前缀形式通常与特定的数据归档体系相关，但源站未提供关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、患者纳入标准或样本处理流程的更多说明。因此，关于采集与来源的详细背景，源站未提供。
【适用场景】
基于其主题标签与实验设计，该数据集适用于肿瘤基因组学相关的研究场景，尤其是针对血管肉瘤的突变流行情况分析。研究者可能利用该数据集考察既往已发现突变在血管肉瘤患者中的出现频率，或将其作为该疾病分子特征研究的参考数据之一。此外，对于关注靶向 pulldown 与测序策略在罕见肿瘤中应用的研究者，该数据集也可能具备一定的参考价值。然而，由于源站未提供数据规模、突变列表及样本注释等关键信息，其具体适用场景的边界尚无法进一步明确，源站未提供更详细的适用说明。
【使用方法】
关于该数据集的具体使用方法，源站未提供。通常此类测序数据可能需要借助相应的分析流程进行突变识别与频率统计，但针对本数据集的实际操作步骤、所需软件、参考基因组版本以及数据访问方式等，源站均未提供说明。
【质量与限制】
该数据集基于定制靶向 pulldown 实验与测序产生，其设计目标明确，即确定既往已发现突变在血管肉瘤患者中的流行情况。然而，源站未提供关于数据质量评估、覆盖深度、重复性验证、样本量大小以及潜在偏倚等方面的信息。此外，由于血管肉瘤本身较为罕见，样本来源可能相对有限，但源站未提供具体样本数量，无法就此作出判断。总体而言，该数据集在质量与限制方面的详细信息，源站未提供。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式与许可条款，源站未提供。使用者如需引用或使用该数据集，应另行查阅来源站 omicsdi.org 上的相关说明，以获取准确的引用格式与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001000679
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
将对血管肉瘤患者进行定制靶向拉取实验。所得产物将进行测序，以确定这些患者中先前发现的突变的流行率。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
