单细胞分辨率下拉伸对小鼠皮下角叉菜胶炎症模型影响的数据集

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A1f1a23c27d29dad8aa28b6c969a6a0f60507d96ca1a1625f013eadf44692c776

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

理解影响炎症生物学反应的因素至关重要，因为炎症参与多种生理和病理过程，包括组织修复/愈合、癌症、感染和自身免疫性疾病。我们此前已证明，在大鼠体内进行拉伸可减轻炎症并增加局部促炎症消退脂质介质，提示拉伸对炎症消退具有直接的机械效应。本研究旨在小鼠皮下角叉菜胶炎症模型中，进一步探讨拉伸在细胞/分子层面的效应。每天拉伸10分钟、每日两次可减轻炎症，在角叉菜胶注射后48小时增加促炎症消退介质通路中间体17-HDHA的产生，并在96小时降低促炎症消退和促炎介质（如PGE2和PGD2）的水平。对96小时炎症病灶的ScRNAseq分析显示，拉伸增加了促炎基因（Nos2）和促炎症消退……所有超声数据采集和测量均由对干预条件不知情的研究人员完成。

背部超声图像在异氟烷麻醉下采集。使用高频超声扫描仪（Vevo 2100，Fujifilm VisualSonics，加拿大多伦多），B模式，配21 MHz换能器（MS 250），以获得最佳空间分辨率。将导电凝胶离心5分钟以去除气泡，然后涂抹于皮肤上。换能器用夹钳固定，并安装于铰接臂上，以控制换能器与皮肤表面之间的距离和角度。换能器以横向或矢状方向垂直于背部皮肤放置，并以病变区域为中心。总病变面积通过取横向和矢状位测量的病变面积平均值计算。流式细胞术 将炎症病变切除，用手术刀在5% FBS-DMEM中切碎，然后将悬液通过70mm滤网过滤

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。