单细胞分辨率下拉伸对小鼠皮下角叉菜胶炎症模型影响数据集

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A6a399b8fddb8ee4b3d905cea5b3173635d0eb2175f48bc29c4b74e7d184c96a1

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

理解影响炎症生物学反应的因素至关重要，因为炎症参与多种生理和病理过程，包括组织修复/愈合、癌症、感染和自身免疫性疾病。我们此前已证明，在大鼠体内进行拉伸可减轻炎症并增加局部促炎症消退脂质介质，提示拉伸对炎症消退具有直接的机械效应。本研究旨在利用小鼠皮下角叉菜胶炎症模型，在细胞/分子水平进一步探讨拉伸的效果。每天拉伸两次、每次10分钟可减轻炎症，在角叉菜胶注射后48小时增加促炎症消退介质通路中间产物17-HDHA的生成，并在96小时降低促炎症消退和促炎介质（如PGE2和PGD2）的水平。对96小时炎症病灶的ScRNAseq分析显示，拉伸增加了促炎基因（Nos2）和促炎症消退……所有超声数据采集和测量均由对干预条件不知情的研究人员完成。背部超声图像在异氟烷麻醉下采集。

使用高频超声扫描仪（Vevo 2100，Fujifilm VisualSonics，加拿大多伦多），以B模式配合21 MHz换能器（MS 250）以获得最佳空间分辨率。将导电凝胶离心5分钟以去除气泡，然后涂抹于皮肤表面。换能器用夹具固定，并安装于铰接臂上，以控制换能器与皮肤表面之间的距离和角度。换能器以横向或矢状方向垂直于背部皮肤放置，并对准病变区域中心。通过取横向和矢状位测量的病变面积平均值来计算总病变面积。流式细胞术：切除炎症病变，在5% FBS-DMEM中用手术刀切碎，然后将悬液通过70mm滤网过滤。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。