口腔癌基因组不稳定性与颈淋巴结转移风险的不同路径
该数据集来自 omicsdi.org，主题标签为 Transcriptomics，聚焦口腔癌发生过程中的基因组不稳定性与颈淋巴结转移风险
基本信息
资源简介
口腔癌基因组不稳定性与颈淋巴结转移风险的不同路径
该数据集来自 omicsdi.org，主题标签为 Transcriptomics，聚焦口腔癌发生过程中的基因组不稳定性与颈淋巴结转移风险。源站描述指出，+3q24-qter、-8pter-p23.1、+8q12-q24.2 和 +20 是早期事件，可区分两种临床行为不同的口腔癌路径：3q8pq20 亚型占 75-80%，伴随染色体不稳定和转移风险；非 3q8pq20 亚型占 20-25%，染色体稳定且转移风险低。+3q、-8p、+8q 和 +20 可作为口腔 SCC 转移的生物标志物。该数据可用于研究口腔癌分子分型、进展预测及转移风险评估（来源 omicsdi.org）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：临床上明显的口腔病变，即口腔上皮异型增生，先于口腔鳞状细胞癌（SCC）的发生，并被认为通过获得遗传或表观遗传改变而转化为癌症。在此，我们表明，+3q24-qter、-8pter-p23.1、+8q12-q24.2 和 +20 是早期事件，可识别出临床行为不同的两种口腔癌路径。这些拷贝数异常中的一个或多个存在于主要亚群（3q8pq20 亚型，占病变的 75-80%）中，该亚群伴随染色体不稳定和转移风险而发生，而在较小且染色体稳定的非 3q8pq20 亚群（占病变的 20-25%）中则不存在，该亚群与低转移风险相关。因此，+3q、-8p、+8q 和 +20 是口腔 SCC 转移的生物标志物。另一方面，虽然基因组改变数量的增加可能是进展为癌症的先兆，但异型增生病变 la
【主题与分类】
主题标签：Transcriptomics。本站分类：肿瘤。
【获取与许可】
源站页面：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-28407
下载信息
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源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-28407
标准获取流程：
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
临床上明显的口腔病变，即口腔上皮异常增生，先于口腔鳞状细胞癌（SCC）的发生，并被认为通过获得遗传或表观遗传改变而转化为癌症。在此，我们表明，+3q24-qter、-8pter-p23.1、+8q12-q24.2 和 +20 是早期事件，可识别出临床行为不同的两种口腔癌发生途径。这些拷贝数畸变中的一个或多个存在于主要亚组（3q8pq20 亚型，占病变的 75-80%）中，该亚组发生过程中伴有染色体不稳定和转移风险，而在较小且染色体稳定的非 3q8pq20 亚组（占病变的 20-25%）中缺失，该亚组与低转移风险相关。因此，+3q、-8p、+8q 和 +20 是口腔 SCC 转移的生物标志物。另一方面，尽管基因组改变数量增加可能是癌症进展的先兆，但缺乏拷贝数变化的异常增生病灶不能被视为良性，因为它们是 非 3q8pq20 口腔 SCC 的潜在前驱病变。63 例口腔 SCC 及邻近正常组织区域，44 例口腔异常增生
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