TCGA-MESO 系列的 DICOM 转换幻灯片显微图像

该数据集对应于美国国家癌症研究所影像数据共享平台(IDC)提供的一批图像和/或图像衍生数据。该数据集由 IDC 团队转换为 DICOM 表示并收录

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2026-10-07 更新
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医学影像分类肿瘤间皮瘤TCGA-MESODICOM幻灯片显微图像IDC医学影像
DICOM converted Slide Microscopy images for the TCGA-MESO collection

基本信息

模态
医学影像
大小
0.000062098 GB
任务类型
分类
许可
Creative Commons Attribution 3.0 Unported
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

TCGA-MESO 系列的 DICOM 转换幻灯片显微图像

该数据集英文名为 DICOM converted Slide Microscopy images for the TCGA-MESO collection,对应美国国家癌症研究所影像数据共享平台(IDC)提供的一批图像和/或图像衍生数据,由 IDC 团队转换为 DICOM 表示并收录。数据集与 TCGA-MESO 集合相关,属于肿瘤领域,本站分类为肿瘤 / 其他。其来源站为 doi.org,作者包括 Clunie, David、Clifford, William、Pot, David、Wagner, Ulrike、Farahani, Keyvan、Kim, Erika、Fedorov, Andrey,机构为 Zenodo,发布时间为 2026 年,许可为 Creative Commons Attribution 3.0 Unported。用户可通过 IDC Portal 浏览和可视化相应图像,并利用该 Zenodo 记录中包含的清单按下载说明获取该集合。

【数据集背景】

该数据集面向 TCGA-MESO 集合,提供经 DICOM 转换的幻灯片显微图像。其背景与间皮瘤相关。间皮瘤是一种罕见癌症,影响覆盖胸腔、腹腔以及其中大多数器官的薄层组织,这一衬里称为间皮。在美国,每年大约有 3,000 例新诊断病例。接触石棉是罹患该疾病的主要风险因素,男性往往更常受到影响,这一事实很可能与男性更可能从事相关职业有关。该数据集由 IDC 团队转换为 DICOM 表示并收录,属于美国国家癌症研究所影像数据共享平台提供的图像和/或图像衍生数据集合的一部分。

【数据内容】

该数据集对应一批图像和/或图像衍生数据,具体为 DICOM 转换后的幻灯片显微图像,与 TCGA-MESO 集合相关。数据集名称明确指向 DICOM converted Slide Microscopy images。除上述内容外,源站未提供关于图像数量、分辨率、染色方法、文件大小或具体病例数的更多信息。

【采集与来源】

该数据集来源于美国国家癌症研究所影像数据共享平台(IDC)。它对应于 IDC 提供的一批图像和/或图像衍生数据,并由 IDC 团队转换为 DICOM 表示后收录。来源站为 doi.org,机构为 Zenodo。作者包括 Clunie, David、Clifford, William、Pot, David、Wagner, Ulrike、Farahani, Keyvan、Kim, Erika、Fedorov, Andrey。发布时间为 2026 年。关于原始采集机构、扫描设备、扫描参数或患者人群等细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集可用于探索和可视化与 TCGA-MESO 集合相关的幻灯片显微图像。用户可通过 IDC Portal 浏览和可视化相应图像。该数据集属于肿瘤领域,本站分类为肿瘤 / 其他,适用于与间皮瘤相关的图像数据查看和图像衍生数据使用。关于具体的科研分析场景、算法训练或临床用途,源站未提供。

【使用方法】

用户可以使用 IDC Portal 探索和可视化相应图像。该 Zenodo 记录中包含清单,用户可按照下载说明下载该集合。关于下载后的具体处理步骤、软件要求或数据读取方式,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集由 IDC 团队转换为 DICOM 表示并收录,用户可通过 IDC Portal 浏览和可视化。关于数据质量、完整性、标注准确性、覆盖范围或使用限制,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的许可为 Creative Commons Attribution 3.0 Unported。作者包括 Clunie, David、Clifford, William、Pot, David、Wagner, Ulrike、Farahani, Keyvan、Kim, Erika、Fedorov, Andrey。机构为 Zenodo,发布时间为 2026 年,来源站为 doi.org。关于具体引用格式或附加引用要求,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://doi.org/10.5281/zenodo.22837386

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 62.1 KB。

数据说明

本数据集对应于美国国家癌症研究所影像数据共享平台(IDC)提供的一系列图像及/或源自图像的数据。该数据集已被IDC团队转换为DICOM格式并收录。您可以通过IDC Portal探索并可视化相应的图像。利用本Zenodo记录中包含的清单文件,按照下方下载指南即可下载该集合。间皮瘤是一种罕见癌症,影响覆盖胸腔、腹腔及其内部大部分器官的薄层组织,这一衬层被称为间皮。在美国,每年大约有3,000例新诊断病例。接触石棉是罹患此病的主要风险因素,男性患者更为常见——这一现象很可能与男性更可能从事接触石棉的工作有关。请参阅TCGA-MESO信息页面,以了解更多关于图像的信息并获取此集合的任何支持性元数据。包含的文件清单文件名指示了IDC数据发布版本,其中首次引入了集合数据的某一版本。

例如,tcga_meso-idc_v22-aws.s5cmd 对应于 IDC 数据发布 v22 中引入的 tcga_meso 集合的内容。tcga_meso-idc_v25-aws.s5cmd:AWS 下载清单 tcga_meso-idc_v25-gcs.s5cmd:GCS 下载清单 tcga_meso-idc_v25-dcf.dcf:DCF 下载清单 以 -aws.s5cmd 结尾的清单文件引用 Amazon Web Services (AWS) 存储桶中的文件;以 -gcs.s5cmd 结尾的清单文件引用 Google Cloud Storage 中的文件。实际文件完全相同,并在 AWS 和 GCP 之间镜像。下载说明 每个清单文件的头部都包含有关如何下载所含文件的说明。要使用 .s5cmd 清单下载文件:安装 idc-index:pip install --upgrade idc-index 下载此数据集中包含的清单所引用的文件:idc download manifest.s5cmd 要

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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