基于尿液 EOMES、HOXA9、POU4F2、TWIST1、VIM 和 ZNF154 高甲基化诊断膀胱癌复发

该数据集来自 plos.figshare.com,围绕非肌层浸润性膀胱癌(NMIBC)复发诊断,包含 184 例 NMIBC 患者的 390 份尿液沉渣及 35 名年龄匹配对照者的尿液样本

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2023-05-31 更新
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基因组分类bladdercancerrecurrencebasedurinarylevelshypermethylation
Diagnosis of Bladder Cancer Recurrence Based on Urinary Levels of EOMES, HOXA9, POU4F2, TWIST1, VIM, and ZNF154 Hypermethylation

基本信息

模态
基因组
大小
0.003962701 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-05-31
版本
v1

资源简介

基于尿液 EOMES、HOXA9、POU4F2、TWIST1、VIM 和 ZNF154 高甲基化诊断膀胱癌复发

Diagnosis of Bladder Cancer Recurrence Based on Urinary Levels of EOMES, HOXA9, POU4F2, TWIST1, VIM, and ZNF154 Hypermethylation

该数据集来自 plos.figshare.com,围绕非肌层浸润性膀胱癌(NMIBC)复发诊断,包含 184 例 NMIBC 患者的 390 份尿液沉渣及 35 名年龄匹配对照者的尿液样本。研究通过实时 PCR(MethyLight)检测 EOMES、HOXA9、POU4F2、TWIST1、VIM 和 ZNF154 的甲基化水平,复发由膀胱镜诊断并经组织学验证。数据集含 10 个文件,包括补充图与补充表,配套论文发表于 PLoS ONE(2012)。可用于膀胱癌复发相关甲基化标志物的分类建模与验证(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《Diagnosis of Bladder Cancer Recurrence Based on Urinary Levels of EOMES, HOXA9, POU4F2, TWIST1, VIM, and ZNF154 Hypermethylation》发表于 PLoS ONE(2012),DOI:10.1371/journal.pone.0046297。源站首次发布:2012-10-03。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):背景 非肌层浸润性膀胱癌(NMIBC)在所有恶性肿瘤中复发率最高,多达 70% 的患者经历复发。异常 DNA 甲基化存在于所有膀胱肿瘤中,并可在尿液标本中检测到。先前的研究已鉴定出具有显著诊断价值的 DNA 甲基化标志物。我们评估了这些生物标志物在尿液中对肿瘤复发的早期检测的意义。方法/主要发现 通过实时 PCR(MethyLight)测量尿液标本中 EOMES、HOXA9、POU4F2、TWIST1、VIM 和 ZNF154 的甲基化水平。我们分析了来自 184 名诊断为 NMIBC 患者的 390 份尿液沉渣。来自 35 名年龄匹配的对照个体的尿液用于确定甲基化基线水平。复发由膀胱镜诊断并经组织学验证。最初,我们比较了来自膀胱 ca

【数据结构与技术规格】

文件数 10 个,合计 3.96 MB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0046297。

【主题与分类】

源站学科分类:Cancer、Cell Biology、Genetics。主题标签:bladder、cancer、recurrence、based、urinary、levels、hypermethylation。本站分类:肿瘤。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Cancer、Cell Biology、Genetics。

【获取与许可】

源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/Diagnosis_of_Bladder_Cancer_Recurrence_Based_on_Urinary_Levels_of_EOMES_HOXA9_POU4F2_TWIST1_VIM_and_ZNF154_Hypermethylation/118975

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Reinert, Thomas; Borre, Michael; Christiansen, Anders; G. Hermann, Gregers; F. Ørntoft, Torben; Dyrskjøt, Lars (2016). Diagnosis of Bladder Cancer Recurrence Based on Urinary Levels of EOMES, HOXA9, POU4F2, TWIST1, VIM, and ZNF154 Hypermethylation. PLOS ONE. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-05-31,引用时请注意版本时效。

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文件清单

  • Figure_S1.eps(829.59 KB)
  • Figure_S2.eps(1.64 MB)
  • Figure_S3.eps(1.24 MB)
  • Table_S1.docx(24.42 KB)
  • Table_S2.docx(19.91 KB)
  • Table_S3.doc(51.71 KB)
  • Table_S4.doc(58.37 KB)
  • Table_S5.doc(59.90 KB)
  • Table_S6.docx(21.48 KB)
  • Table_S7.docx(21.33 KB)

文件总体积 3.96 MB(源站 API 实测)。

数据说明

背景
非肌层浸润性膀胱癌(NMIBC)在所有恶性肿瘤中复发率最高,多达70%的患者会经历复发。异常的DNA甲基化存在于所有膀胱肿瘤中,并可在尿液标本中检测到。先前的研究已识别出具有显著诊断价值的DNA甲基化标志物。我们评估了这些生物标志物在尿液中早期检测肿瘤复发的意义。

方法/主要发现
通过实时PCR(MethyLight)测定了尿液标本中EOMES、HOXA9、POU4F2、TWIST1、VIM和ZNF154的甲基化水平。我们分析了184例诊断为NMIBC患者的390份尿液沉渣。使用35名年龄匹配的对照个体的尿液来确定甲基化基线水平。复发通过膀胱镜检查诊断,并经组织学验证。最初,我们比较了膀胱癌患者和健康个体的尿液,发现所有六个标志物均存在显著的高甲基化(PEOMES、POU4F2、VIM和ZNF154在更高分级肿瘤患者的尿液中甲基化频率更高(P≤0.08)。

单因素Cox回归分析显示,有五个标志物与疾病复发显著相关:HOXA9(HR=7.8,P=0.006)、POU4F2(HR=8.5,P=0.001)、TWIST1(HR=12.0,P=0.015)、VIM(HR=8.0,P=0.001)和ZNF154(HR=13.9,P结论/意义
尿标本中EOMES、HOXA9、POU4F2、TWIST1、VIM和ZNF154的甲基化水平是膀胱癌复发监测的有前景的诊断生物标志物。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0046297(source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/Diagnosis_of_Bladder_Cancer_Recurrence_Based_on_Urinary_Levels_of_EOMES_HOXA9_POU4F2_TWIST1_VIM_and_ZNF154_Hypermethylation/118975)。

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