蛋白质冠-银纳米颗粒分析后SWATH-MS检测非肌层浸润性膀胱癌循环血清蛋白生物标志物

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD028310

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

由于膀胱镜检查费用高昂且具有侵入性，因此需要一种检测非肌层浸润性膀胱癌（NMIBC）的新方法。本研究旨在识别NMIBC的潜在血清蛋白标志物，以改善诊断，并建立治疗方法，避免疾病进展为危及生命的表型（肌层浸润性膀胱癌，MIBC）。在此，银纳米颗粒（AgNPs，9.73 ± 1.70 nm）作为清除装置，结合全理论质谱序列窗口采集（SWATH-MS），用于定量分析两种NMIBC亚型（T1和Ta）的血清蛋白改变，并与正常样本（HC）进行比较。NMIBC血清样本分析鉴定出三大类蛋白质，其相对含量与HC不同：参与补体和凝血级联通路的蛋白质以及载脂蛋白。总之，研究鉴定出许多生物标志物蛋白，值得进一步研究，以验证其在NMIBC患者临床管理中的有用意义和实用性。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。