APOLLO 网络食管鳞状细胞癌队列影像与蛋白质基因组学数据集

数据集获取

源站：https://doi.org/10.7937/n69a-7a26

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集包含来自美国国家癌症研究所（NCI）应用蛋白质基因组学组织学习与结局（APOLLO）网络食管鳞状细胞癌队列的受试者。APOLLO网络是NCI、国防部（DoD）和退伍军人事务部（VA）之间的合作项目，旨在将蛋白质基因组学纳入患者护理，从而超越基因组层面，探究基因组所编码蛋白质的活性和表达。蛋白质基因组学这一新兴领域旨在通过筛查肿瘤的遗传异常和蛋白质信息，更好地预测患者对治疗的反应，近年来蛋白质组学技术的进步使这种方法成为可能。癌症影像档案（The Cancer Imaging Archive）正在收集APOLLO患者的放射学和病理学图像并公开提供，以使研究人员能够研究与相应蛋白质组学、基因组学和临床数据可能相关的癌症表型。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。