基于细胞学深度学习的原发灶不明肿瘤起源预测数据

该数据集来自 springernature.figshare.com,包含细胞学图像,覆盖良性组、消化系统(含腔道消化系统与分泌性消化系统)、女性生殖系统(含乳腺癌)、呼吸系统及血液淋巴系统

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2024-04-17 更新
浏览 2
图像分类Cancer of unknown primary (CUP)
Data from: Prediction of tumor origin in cancers of unknown primary origin with cytology-based deep learning

基本信息

模态
图像
大小
0.824012299 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2024-04-17
版本
v1

资源简介

基于细胞学深度学习的原发灶不明肿瘤起源预测数据

Prediction of tumor origin in cancers of unknown primary origin with cytology-based deep learning

该数据集来自 springernature.figshare.com,包含细胞学图像,覆盖良性组、消化系统(含腔道消化系统与分泌性消化系统)、女性生殖系统(含乳腺癌)、呼吸系统及血液淋巴系统。数据以 cytological images.rar 单个压缩文件提供,可用于训练和评估基于深度学习的肿瘤起源预测模型,面向原发灶不明肿瘤(CUP)的溯源分类研究(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《Prediction of tumor origin in cancers of unknown primary origin with cytology-based deep learning》发表于 Nature Medicine(2024),DOI:10.1038/s41591-024-02915-w。源站首次发布:2024-04-17。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):细胞学图像,包括良性组、消化系统(由腔道消化系统和分泌性消化系统组成)、女性生殖系统(包括乳腺癌)、呼吸系统和血液淋巴系统

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 824.01 MB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.25270066.v1。

【主题与分类】

源站学科分类:Cancer Diagnosis。主题标签:Cancer of unknown primary (CUP)。本站分类:肿瘤。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Cancer Diagnosis。

【获取与许可】

源站页面:https://springernature.figshare.com/articles/dataset/Prediction_of_tumor_origin_in_cancers_of_unknown_primary_origin_with_cytology-based_deep_learning/25270066

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Tian, Fei (2024). Prediction of tumor origin in cancers of unknown primary origin with cytology-based deep learning. figshare. Dataset

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使用方式

数据集获取(Figshare)

命令行下载

curl -L -o "cytological images.rar" "https://ndownloader.figshare.com/files/44738662"

文件清单

  • cytological images.rar(824.01 MB)

文件总体积 824.01 MB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

Cytological images including benign group, digestive system (consisting of both cavity digestive system and secretory digestive system), female reproductive system (including breast cancer), respiratory system and blood-lymphatic system

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.6084/m9.figshare.25270066.v1(source: https://springernature.figshare.com/articles/dataset/Prediction_of_tumor_origin_in_cancers_of_unknown_primary_origin_with_cytology-based_deep_learning/25270066)。

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