良恶性唾液腺肿瘤组织、血液和唾液样本microRNA表达谱比较数据

该数据集来自scielo.figshare.com,对应一项前瞻性病例对照研究,比较良恶性唾液腺肿瘤在组织、血液和唾液样本中的microRNA表达谱

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2023-06-01 更新
浏览 6
其他分类Salivary gland tumorMicroRNAmiR-21miR-30ePathogenesis
Data from: Comparison of microRNA profiles between benign and malignant salivary gland tumors in tissue, blood and saliva samples: a prospective, case-control study

基本信息

模态
其他
大小
0.003132299 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-06-01
版本
v1

资源简介

良恶性唾液腺肿瘤组织、血液和唾液样本microRNA表达谱比较数据

Comparison of microRNA profiles between benign and malignant salivary gland tumors in tissue, blood and saliva samples: a prospective, case-control study

该数据集来自scielo.figshare.com,对应一项前瞻性病例对照研究,比较良恶性唾液腺肿瘤在组织、血液和唾液样本中的microRNA表达谱。研究纳入20例唾液腺肿瘤患者(16例良性、4例恶性)和17例无恶性肿瘤或唾液腺疾病的对照,检测95个microRNA,并采集血清、唾液及肿瘤组织样本。数据可用于探索良恶性唾液腺肿瘤的差异microRNA表达及潜在生物标志物,涉及miR-21、miR-23a、miR-27a、miR-223、miR-125b等分子(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《Comparison of microRNA profiles between benign and malignant salivary gland tumors in tissue, blood and saliva samples: a prospective, case-control study》发表于 Brazilian Journal of Otorhinolaryngology(2017),DOI:10.1016/j.bjorl.2016.03.013。源站首次发布:2022-06-07。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):摘要 引言:唾液腺肿瘤(SGTs)是罕见的头颈部恶性肿瘤,由具有不同生物学行为的肿瘤谱系组成。目的:在本研究中,我们旨在发现良性和恶性SGTs之间microRNA谱的差异表达。方法:我们在20例唾液腺肿瘤患者中研究了95个microRNA的可能作用,并与17例无恶性肿瘤或唾液腺疾病的患者进行比较。16例肿瘤为良性(7例多形性腺瘤,9例Warthin瘤),4例为恶性(2例鳞状细胞癌,1例高级别黏液表皮样癌,1例腺癌)。从患者和对照组均采集血清和唾液样本。从患者组还采集了肿瘤肿块的组织样本。结果:在所研究的microRNA中,miR-21、miR-23a、miR-27a、miR-223、miR-125b

【数据结构与技术规格】

文件数 8 个,合计 3.13 MB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.20014718.v1。

【主题与分类】

源站学科分类:Otorhinolaryngology。主题标签:Salivary gland tumor、MicroRNA、miR-21、miR-30e、Pathogenesis。本站分类:肿瘤。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Otorhinolaryngology。

【获取与许可】

源站页面:https://scielo.figshare.com/articles/dataset/Comparison_of_microRNA_profiles_between_benign_and_malignant_salivary_gland_tumors_in_tissue_blood_and_saliva_samples_a_prospective_case-control_study/20014718

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Cinpolat, Ovgu; Unal, Zeynep Nil; Ismi, Onur; Gorur, Aysegul; Unal, Murat (2017). Comparison of microRNA profiles between benign and malignant salivary gland tumors in tissue, blood and saliva samples: a prospective, case-control study. SciELO journals. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-01,引用时请注意版本时效。

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文件清单

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  • b9cd342e9291f5220a4eb9083423ee40bcf6fb27.jpg(240.57 KB)

文件总体积 3.13 MB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

摘要 引言:唾液腺肿瘤(SGTs)是罕见的头颈部恶性肿瘤,由一系列具有不同生物学行为的肿瘤组成。目的:本研究旨在探究良性与恶性SGTs之间microRNA表达谱的差异。方法:我们研究了95种microRNA在20例唾液腺肿瘤患者中的可能作用,并与17例无恶性肿瘤或唾液腺疾病的患者进行比较。其中16例肿瘤为良性(7例多形性腺瘤,9例Warthin瘤),4例为恶性(2例鳞状细胞癌,1例高级别黏液表皮样癌,1例腺癌)。患者组和对照组均采集了血清和唾液样本。患者组还采集了肿瘤肿块的组织样本。结果:在所研究的microRNA中,与对照组相比,良性组血清样本中miR-21、miR-23a、miR-27a、miR-223、miR-125b、miR-126、miR-146a、miR-30e表达下调(p值分别为0.04、0.00005、0.00005、0.0022、0.031、0.00008、0.044和0.0007)。

在研究组织样本时,与良性组相比,恶性组的miR-21、miR-31、miR-199a-5p、miR-146b、miR-345表达上调(p值分别为0.006、0.02、0.013、0.013、0.041)。与良性组相比,恶性肿瘤组血浆样本中miR-30e的表达上调具有统计学显著性(p = 0.034)。各组间唾液样本无统计学显著差异。结论:我们的结果表明,根据生物学行为,不同的microRNA可能在唾液腺肿瘤发病机制中发挥作用。尽管各组间唾液样本无差异,但根据组织和血清样本,miR-21和miR-30e可能具有重要作用;因为它们在良性肿瘤中表达下调,而在恶性肿瘤中表达上调。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.6084/m9.figshare.20014718.v1(source: https://scielo.figshare.com/articles/dataset/Comparison_of_microRNA_profiles_between_benign_and_malignant_salivary_gland_tumors_in_tissue_blood_and_saliva_samples_a_prospective_case-control_study/20014718)。

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